Protein–RNA interactions for Protein: P19532

TFE3, Transcription factor E3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFE3P19532 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TFE3P19532 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TFE3P19532 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TFE3P19532 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TFE3P19532 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TFE3P19532 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TFE3P19532 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TFE3P19532 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TFE3P19532 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TFE3P19532 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TFE3P19532 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TFE3P19532 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TFE3P19532 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TFE3P19532 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TFE3P19532 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TFE3P19532 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TFE3P19532 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TFE3P19532 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TFE3P19532 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TFE3P19532 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TFE3P19532 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TFE3P19532 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TFE3P19532 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TFE3P19532 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TFE3P19532 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TFE3P19532 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TFE3P19532 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TFE3P19532 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TFE3P19532 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TFE3P19532 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TFE3P19532 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TFE3P19532 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TFE3P19532 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TFE3P19532 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TFE3P19532 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TFE3P19532 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TFE3P19532 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TFE3P19532 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TFE3P19532 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TFE3P19532 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TFE3P19532 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TFE3P19532 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TFE3P19532 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TFE3P19532 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TFE3P19532 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TFE3P19532 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TFE3P19532 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TFE3P19532 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TFE3P19532 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TFE3P19532 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TFE3P19532 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TFE3P19532 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TFE3P19532 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TFE3P19532 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TFE3P19532 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TFE3P19532 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TFE3P19532 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TFE3P19532 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TFE3P19532 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TFE3P19532 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TFE3P19532 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TFE3P19532 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TFE3P19532 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TFE3P19532 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TFE3P19532 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TFE3P19532 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TFE3P19532 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TFE3P19532 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TFE3P19532 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TFE3P19532 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TFE3P19532 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TFE3P19532 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TFE3P19532 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TFE3P19532 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TFE3P19532 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TFE3P19532 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TFE3P19532 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TFE3P19532 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TFE3P19532 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TFE3P19532 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TFE3P19532 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TFE3P19532 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TFE3P19532 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TFE3P19532 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TFE3P19532 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TFE3P19532 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TFE3P19532 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TFE3P19532 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TFE3P19532 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TFE3P19532 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TFE3P19532 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TFE3P19532 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TFE3P19532 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TFE3P19532 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TFE3P19532 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TFE3P19532 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TFE3P19532 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TFE3P19532 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TFE3P19532 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TFE3P19532 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms