Protein–RNA interactions for Protein: P17655

CAPN2, Calpain-2 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN2P17655 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CAPN2P17655 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CAPN2P17655 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CAPN2P17655 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CAPN2P17655 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CAPN2P17655 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CAPN2P17655 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CAPN2P17655 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CAPN2P17655 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CAPN2P17655 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CAPN2P17655 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CAPN2P17655 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CAPN2P17655 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CAPN2P17655 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CAPN2P17655 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CAPN2P17655 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CAPN2P17655 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CAPN2P17655 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CAPN2P17655 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CAPN2P17655 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CAPN2P17655 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CAPN2P17655 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CAPN2P17655 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CAPN2P17655 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CAPN2P17655 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CAPN2P17655 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CAPN2P17655 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CAPN2P17655 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CAPN2P17655 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CAPN2P17655 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CAPN2P17655 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CAPN2P17655 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CAPN2P17655 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CAPN2P17655 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CAPN2P17655 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CAPN2P17655 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CAPN2P17655 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CAPN2P17655 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CAPN2P17655 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CAPN2P17655 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CAPN2P17655 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CAPN2P17655 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CAPN2P17655 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CAPN2P17655 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CAPN2P17655 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CAPN2P17655 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CAPN2P17655 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CAPN2P17655 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAPN2P17655 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAPN2P17655 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAPN2P17655 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAPN2P17655 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAPN2P17655 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAPN2P17655 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CAPN2P17655 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CAPN2P17655 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CAPN2P17655 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CAPN2P17655 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CAPN2P17655 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CAPN2P17655 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CAPN2P17655 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CAPN2P17655 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CAPN2P17655 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CAPN2P17655 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CAPN2P17655 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CAPN2P17655 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CAPN2P17655 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CAPN2P17655 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CAPN2P17655 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CAPN2P17655 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CAPN2P17655 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CAPN2P17655 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CAPN2P17655 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CAPN2P17655 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CAPN2P17655 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CAPN2P17655 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CAPN2P17655 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CAPN2P17655 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CAPN2P17655 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CAPN2P17655 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CAPN2P17655 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CAPN2P17655 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CAPN2P17655 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CAPN2P17655 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CAPN2P17655 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CAPN2P17655 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CAPN2P17655 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CAPN2P17655 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CAPN2P17655 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CAPN2P17655 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CAPN2P17655 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CAPN2P17655 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CAPN2P17655 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CAPN2P17655 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CAPN2P17655 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CAPN2P17655 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CAPN2P17655 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CAPN2P17655 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CAPN2P17655 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CAPN2P17655 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms