Protein–RNA interactions for Protein: P17301

ITGA2, Integrin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA2P17301 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGA2P17301 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGA2P17301 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGA2P17301 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGA2P17301 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGA2P17301 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGA2P17301 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGA2P17301 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGA2P17301 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGA2P17301 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGA2P17301 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITGA2P17301 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITGA2P17301 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITGA2P17301 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITGA2P17301 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITGA2P17301 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITGA2P17301 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITGA2P17301 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITGA2P17301 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITGA2P17301 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITGA2P17301 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITGA2P17301 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGA2P17301 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGA2P17301 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGA2P17301 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGA2P17301 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGA2P17301 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGA2P17301 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGA2P17301 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGA2P17301 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGA2P17301 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGA2P17301 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGA2P17301 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGA2P17301 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
ITGA2P17301 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ITGA2P17301 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ITGA2P17301 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ITGA2P17301 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ITGA2P17301 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ITGA2P17301 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ITGA2P17301 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ITGA2P17301 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ITGA2P17301 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ITGA2P17301 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ITGA2P17301 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ITGA2P17301 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ITGA2P17301 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ITGA2P17301 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ITGA2P17301 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ITGA2P17301 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ITGA2P17301 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ITGA2P17301 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ITGA2P17301 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ITGA2P17301 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ITGA2P17301 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ITGA2P17301 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ITGA2P17301 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ITGA2P17301 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ITGA2P17301 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ITGA2P17301 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ITGA2P17301 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ITGA2P17301 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ITGA2P17301 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ITGA2P17301 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ITGA2P17301 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ITGA2P17301 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ITGA2P17301 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ITGA2P17301 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ITGA2P17301 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ITGA2P17301 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ITGA2P17301 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ITGA2P17301 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ITGA2P17301 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ITGA2P17301 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ITGA2P17301 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ITGA2P17301 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ITGA2P17301 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ITGA2P17301 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ITGA2P17301 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ITGA2P17301 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ITGA2P17301 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ITGA2P17301 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
ITGA2P17301 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ITGA2P17301 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ITGA2P17301 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ITGA2P17301 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ITGA2P17301 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ITGA2P17301 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ITGA2P17301 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ITGA2P17301 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ITGA2P17301 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ITGA2P17301 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ITGA2P17301 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ITGA2P17301 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ITGA2P17301 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ITGA2P17301 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
ITGA2P17301 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ITGA2P17301 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ITGA2P17301 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ITGA2P17301 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms