Protein–RNA interactions for Protein: P13797

PLS3, Plastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLS3P13797 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PLS3P13797 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PLS3P13797 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PLS3P13797 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PLS3P13797 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLS3P13797 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLS3P13797 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLS3P13797 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLS3P13797 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLS3P13797 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLS3P13797 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLS3P13797 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLS3P13797 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PLS3P13797 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLS3P13797 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLS3P13797 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLS3P13797 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLS3P13797 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLS3P13797 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLS3P13797 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PLS3P13797 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PLS3P13797 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PLS3P13797 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PLS3P13797 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PLS3P13797 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PLS3P13797 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PLS3P13797 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PLS3P13797 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PLS3P13797 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PLS3P13797 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PLS3P13797 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PLS3P13797 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PLS3P13797 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PLS3P13797 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PLS3P13797 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PLS3P13797 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PLS3P13797 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PLS3P13797 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PLS3P13797 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PLS3P13797 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PLS3P13797 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PLS3P13797 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PLS3P13797 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PLS3P13797 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PLS3P13797 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PLS3P13797 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PLS3P13797 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PLS3P13797 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PLS3P13797 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PLS3P13797 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PLS3P13797 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PLS3P13797 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PLS3P13797 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PLS3P13797 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PLS3P13797 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PLS3P13797 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PLS3P13797 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PLS3P13797 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PLS3P13797 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PLS3P13797 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PLS3P13797 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PLS3P13797 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PLS3P13797 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PLS3P13797 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PLS3P13797 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PLS3P13797 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PLS3P13797 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PLS3P13797 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PLS3P13797 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PLS3P13797 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PLS3P13797 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PLS3P13797 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PLS3P13797 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PLS3P13797 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PLS3P13797 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PLS3P13797 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PLS3P13797 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PLS3P13797 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PLS3P13797 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PLS3P13797 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PLS3P13797 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PLS3P13797 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PLS3P13797 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PLS3P13797 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PLS3P13797 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PLS3P13797 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PLS3P13797 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PLS3P13797 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PLS3P13797 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PLS3P13797 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PLS3P13797 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PLS3P13797 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PLS3P13797 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PLS3P13797 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PLS3P13797 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PLS3P13797 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PLS3P13797 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PLS3P13797 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PLS3P13797 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PLS3P13797 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms