Protein–RNA interactions for Protein: P13796

LCP1, Plastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCP1P13796 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LCP1P13796 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LCP1P13796 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LCP1P13796 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LCP1P13796 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LCP1P13796 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LCP1P13796 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LCP1P13796 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LCP1P13796 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LCP1P13796 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LCP1P13796 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LCP1P13796 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LCP1P13796 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LCP1P13796 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LCP1P13796 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LCP1P13796 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LCP1P13796 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LCP1P13796 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LCP1P13796 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LCP1P13796 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LCP1P13796 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LCP1P13796 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LCP1P13796 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LCP1P13796 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LCP1P13796 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LCP1P13796 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LCP1P13796 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LCP1P13796 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LCP1P13796 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LCP1P13796 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LCP1P13796 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LCP1P13796 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LCP1P13796 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LCP1P13796 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LCP1P13796 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LCP1P13796 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LCP1P13796 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LCP1P13796 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LCP1P13796 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LCP1P13796 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LCP1P13796 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LCP1P13796 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
LCP1P13796 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LCP1P13796 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LCP1P13796 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LCP1P13796 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LCP1P13796 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LCP1P13796 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LCP1P13796 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
LCP1P13796 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LCP1P13796 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LCP1P13796 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LCP1P13796 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LCP1P13796 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LCP1P13796 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
LCP1P13796 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LCP1P13796 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LCP1P13796 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LCP1P13796 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LCP1P13796 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LCP1P13796 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LCP1P13796 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LCP1P13796 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LCP1P13796 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LCP1P13796 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LCP1P13796 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
LCP1P13796 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
LCP1P13796 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
LCP1P13796 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
LCP1P13796 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LCP1P13796 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LCP1P13796 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LCP1P13796 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LCP1P13796 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LCP1P13796 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
LCP1P13796 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LCP1P13796 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
LCP1P13796 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LCP1P13796 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LCP1P13796 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LCP1P13796 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LCP1P13796 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LCP1P13796 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LCP1P13796 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LCP1P13796 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LCP1P13796 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LCP1P13796 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LCP1P13796 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LCP1P13796 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LCP1P13796 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LCP1P13796 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LCP1P13796 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LCP1P13796 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LCP1P13796 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LCP1P13796 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LCP1P13796 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LCP1P13796 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LCP1P13796 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LCP1P13796 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LCP1P13796 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms