Protein–RNA interactions for Protein: P13647

KRT5, Keratin, type II cytoskeletal 5, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT5P13647 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT5P13647 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT5P13647 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT5P13647 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT5P13647 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT5P13647 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT5P13647 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT5P13647 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT5P13647 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT5P13647 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT5P13647 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT5P13647 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT5P13647 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT5P13647 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT5P13647 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT5P13647 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT5P13647 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT5P13647 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT5P13647 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT5P13647 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT5P13647 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT5P13647 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT5P13647 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT5P13647 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT5P13647 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT5P13647 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT5P13647 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT5P13647 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT5P13647 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT5P13647 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT5P13647 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT5P13647 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT5P13647 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT5P13647 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT5P13647 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT5P13647 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT5P13647 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT5P13647 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT5P13647 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT5P13647 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT5P13647 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT5P13647 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT5P13647 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT5P13647 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT5P13647 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT5P13647 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT5P13647 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT5P13647 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT5P13647 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT5P13647 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT5P13647 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT5P13647 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT5P13647 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KRT5P13647 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KRT5P13647 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24■■□□□ 1.43
KRT5P13647 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT5P13647 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT5P13647 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KRT5P13647 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KRT5P13647 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT5P13647 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT5P13647 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT5P13647 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT5P13647 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT5P13647 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT5P13647 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT5P13647 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT5P13647 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT5P13647 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT5P13647 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT5P13647 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT5P13647 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT5P13647 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT5P13647 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT5P13647 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT5P13647 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT5P13647 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT5P13647 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT5P13647 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT5P13647 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT5P13647 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT5P13647 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT5P13647 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT5P13647 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT5P13647 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT5P13647 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT5P13647 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT5P13647 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT5P13647 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT5P13647 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT5P13647 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT5P13647 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT5P13647 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT5P13647 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT5P13647 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT5P13647 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT5P13647 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT5P13647 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT5P13647 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT5P13647 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms