Protein–RNA interactions for Protein: P13164

IFITM1, Interferon-induced transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM1P13164 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFITM1P13164 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFITM1P13164 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFITM1P13164 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFITM1P13164 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFITM1P13164 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFITM1P13164 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFITM1P13164 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFITM1P13164 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFITM1P13164 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFITM1P13164 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFITM1P13164 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFITM1P13164 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFITM1P13164 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFITM1P13164 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFITM1P13164 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFITM1P13164 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFITM1P13164 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFITM1P13164 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFITM1P13164 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFITM1P13164 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFITM1P13164 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFITM1P13164 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFITM1P13164 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
IFITM1P13164 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
IFITM1P13164 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFITM1P13164 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFITM1P13164 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFITM1P13164 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFITM1P13164 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFITM1P13164 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFITM1P13164 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFITM1P13164 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFITM1P13164 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFITM1P13164 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFITM1P13164 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFITM1P13164 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFITM1P13164 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFITM1P13164 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFITM1P13164 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFITM1P13164 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
IFITM1P13164 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFITM1P13164 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFITM1P13164 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFITM1P13164 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFITM1P13164 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFITM1P13164 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFITM1P13164 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFITM1P13164 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
IFITM1P13164 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFITM1P13164 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFITM1P13164 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFITM1P13164 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFITM1P13164 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFITM1P13164 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFITM1P13164 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFITM1P13164 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFITM1P13164 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFITM1P13164 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFITM1P13164 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFITM1P13164 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFITM1P13164 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFITM1P13164 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFITM1P13164 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFITM1P13164 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
IFITM1P13164 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
IFITM1P13164 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
IFITM1P13164 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
IFITM1P13164 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
IFITM1P13164 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IFITM1P13164 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFITM1P13164 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFITM1P13164 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IFITM1P13164 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFITM1P13164 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IFITM1P13164 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IFITM1P13164 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFITM1P13164 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IFITM1P13164 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IFITM1P13164 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFITM1P13164 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFITM1P13164 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFITM1P13164 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFITM1P13164 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFITM1P13164 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFITM1P13164 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IFITM1P13164 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFITM1P13164 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFITM1P13164 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFITM1P13164 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC15.07■□□□□ 0
IFITM1P13164 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
IFITM1P13164 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFITM1P13164 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IFITM1P13164 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFITM1P13164 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFITM1P13164 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFITM1P13164 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFITM1P13164 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
IFITM1P13164 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
IFITM1P13164 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms