Protein–RNA interactions for Protein: P12081

HARS, Histidine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HARSP12081 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HARSP12081 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
HARSP12081 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HARSP12081 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HARSP12081 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HARSP12081 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HARSP12081 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HARSP12081 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HARSP12081 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HARSP12081 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HARSP12081 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HARSP12081 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
HARSP12081 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HARSP12081 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HARSP12081 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HARSP12081 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HARSP12081 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HARSP12081 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HARSP12081 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HARSP12081 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HARSP12081 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HARSP12081 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HARSP12081 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HARSP12081 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
HARSP12081 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HARSP12081 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HARSP12081 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HARSP12081 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
HARSP12081 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HARSP12081 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HARSP12081 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HARSP12081 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
HARSP12081 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HARSP12081 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HARSP12081 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HARSP12081 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HARSP12081 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
HARSP12081 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
HARSP12081 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
HARSP12081 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
HARSP12081 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HARSP12081 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HARSP12081 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HARSP12081 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HARSP12081 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HARSP12081 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HARSP12081 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HARSP12081 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HARSP12081 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HARSP12081 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HARSP12081 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HARSP12081 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
HARSP12081 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HARSP12081 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HARSP12081 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HARSP12081 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HARSP12081 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HARSP12081 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HARSP12081 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
HARSP12081 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HARSP12081 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HARSP12081 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HARSP12081 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HARSP12081 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HARSP12081 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HARSP12081 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HARSP12081 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
HARSP12081 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
HARSP12081 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
HARSP12081 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
HARSP12081 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
HARSP12081 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
HARSP12081 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HARSP12081 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HARSP12081 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HARSP12081 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HARSP12081 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HARSP12081 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HARSP12081 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HARSP12081 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HARSP12081 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HARSP12081 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HARSP12081 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HARSP12081 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HARSP12081 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HARSP12081 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HARSP12081 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HARSP12081 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HARSP12081 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HARSP12081 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HARSP12081 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HARSP12081 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HARSP12081 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
HARSP12081 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
HARSP12081 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HARSP12081 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HARSP12081 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HARSP12081 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HARSP12081 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HARSP12081 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms