Protein–RNA interactions for Protein: P11802

CDK4, Cyclin-dependent kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK4P11802 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK4P11802 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK4P11802 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK4P11802 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK4P11802 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK4P11802 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK4P11802 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK4P11802 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK4P11802 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK4P11802 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK4P11802 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK4P11802 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK4P11802 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK4P11802 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK4P11802 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK4P11802 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK4P11802 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK4P11802 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK4P11802 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK4P11802 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK4P11802 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK4P11802 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK4P11802 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK4P11802 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK4P11802 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK4P11802 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK4P11802 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK4P11802 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK4P11802 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK4P11802 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK4P11802 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK4P11802 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK4P11802 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK4P11802 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK4P11802 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK4P11802 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK4P11802 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK4P11802 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK4P11802 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK4P11802 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK4P11802 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK4P11802 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK4P11802 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK4P11802 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK4P11802 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK4P11802 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK4P11802 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK4P11802 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK4P11802 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK4P11802 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK4P11802 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK4P11802 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK4P11802 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDK4P11802 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDK4P11802 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDK4P11802 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDK4P11802 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDK4P11802 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK4P11802 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK4P11802 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK4P11802 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK4P11802 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK4P11802 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK4P11802 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK4P11802 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK4P11802 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK4P11802 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK4P11802 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK4P11802 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK4P11802 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK4P11802 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK4P11802 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK4P11802 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK4P11802 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK4P11802 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK4P11802 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK4P11802 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK4P11802 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK4P11802 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK4P11802 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK4P11802 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK4P11802 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK4P11802 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK4P11802 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK4P11802 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK4P11802 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK4P11802 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK4P11802 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK4P11802 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK4P11802 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK4P11802 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK4P11802 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK4P11802 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK4P11802 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK4P11802 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK4P11802 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK4P11802 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK4P11802 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK4P11802 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK4P11802 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms