Protein–RNA interactions for Protein: P10747

CD28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD28P10747 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CD28P10747 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD28P10747 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD28P10747 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD28P10747 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD28P10747 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD28P10747 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD28P10747 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD28P10747 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD28P10747 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD28P10747 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CD28P10747 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD28P10747 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD28P10747 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD28P10747 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD28P10747 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD28P10747 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD28P10747 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD28P10747 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD28P10747 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD28P10747 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD28P10747 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD28P10747 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD28P10747 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD28P10747 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD28P10747 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD28P10747 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD28P10747 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD28P10747 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD28P10747 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD28P10747 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD28P10747 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD28P10747 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD28P10747 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD28P10747 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD28P10747 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD28P10747 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD28P10747 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD28P10747 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD28P10747 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD28P10747 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD28P10747 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD28P10747 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD28P10747 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD28P10747 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD28P10747 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD28P10747 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD28P10747 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CD28P10747 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD28P10747 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD28P10747 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD28P10747 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD28P10747 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD28P10747 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD28P10747 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD28P10747 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD28P10747 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CD28P10747 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD28P10747 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD28P10747 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CD28P10747 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD28P10747 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD28P10747 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD28P10747 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD28P10747 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD28P10747 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD28P10747 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD28P10747 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD28P10747 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD28P10747 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD28P10747 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD28P10747 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD28P10747 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD28P10747 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD28P10747 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD28P10747 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CD28P10747 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD28P10747 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD28P10747 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD28P10747 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD28P10747 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD28P10747 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD28P10747 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CD28P10747 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD28P10747 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD28P10747 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD28P10747 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD28P10747 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD28P10747 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD28P10747 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD28P10747 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD28P10747 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD28P10747 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD28P10747 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD28P10747 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD28P10747 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD28P10747 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD28P10747 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD28P10747 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD28P10747 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms