Protein–RNA interactions for Protein: P0DJH9

RD3L, Protein RD3-like, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3LP0DJH9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RD3LP0DJH9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RD3LP0DJH9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RD3LP0DJH9 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RD3LP0DJH9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RD3LP0DJH9 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RD3LP0DJH9 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RD3LP0DJH9 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RD3LP0DJH9 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RD3LP0DJH9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RD3LP0DJH9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RD3LP0DJH9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RD3LP0DJH9 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RD3LP0DJH9 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RD3LP0DJH9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RD3LP0DJH9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RD3LP0DJH9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RD3LP0DJH9 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RD3LP0DJH9 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RD3LP0DJH9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RD3LP0DJH9 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RD3LP0DJH9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RD3LP0DJH9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RD3LP0DJH9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RD3LP0DJH9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RD3LP0DJH9 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RD3LP0DJH9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RD3LP0DJH9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RD3LP0DJH9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
RD3LP0DJH9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
RD3LP0DJH9 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RD3LP0DJH9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RD3LP0DJH9 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RD3LP0DJH9 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RD3LP0DJH9 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RD3LP0DJH9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RD3LP0DJH9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RD3LP0DJH9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RD3LP0DJH9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RD3LP0DJH9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RD3LP0DJH9 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RD3LP0DJH9 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RD3LP0DJH9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RD3LP0DJH9 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
RD3LP0DJH9 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RD3LP0DJH9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RD3LP0DJH9 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RD3LP0DJH9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RD3LP0DJH9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RD3LP0DJH9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RD3LP0DJH9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RD3LP0DJH9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RD3LP0DJH9 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RD3LP0DJH9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RD3LP0DJH9 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RD3LP0DJH9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RD3LP0DJH9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RD3LP0DJH9 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RD3LP0DJH9 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RD3LP0DJH9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RD3LP0DJH9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RD3LP0DJH9 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RD3LP0DJH9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RD3LP0DJH9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RD3LP0DJH9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
RD3LP0DJH9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RD3LP0DJH9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RD3LP0DJH9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RD3LP0DJH9 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RD3LP0DJH9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RD3LP0DJH9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RD3LP0DJH9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RD3LP0DJH9 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RD3LP0DJH9 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RD3LP0DJH9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RD3LP0DJH9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RD3LP0DJH9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RD3LP0DJH9 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RD3LP0DJH9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RD3LP0DJH9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RD3LP0DJH9 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RD3LP0DJH9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RD3LP0DJH9 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RD3LP0DJH9 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RD3LP0DJH9 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RD3LP0DJH9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RD3LP0DJH9 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RD3LP0DJH9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
RD3LP0DJH9 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RD3LP0DJH9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RD3LP0DJH9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RD3LP0DJH9 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RD3LP0DJH9 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RD3LP0DJH9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RD3LP0DJH9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RD3LP0DJH9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RD3LP0DJH9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RD3LP0DJH9 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RD3LP0DJH9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RD3LP0DJH9 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.2 ms