Protein–RNA interactions for Protein: P09497

CLTB, Clathrin light chain B, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTBP09497 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLTBP09497 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLTBP09497 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLTBP09497 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLTBP09497 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLTBP09497 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLTBP09497 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLTBP09497 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLTBP09497 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLTBP09497 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLTBP09497 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLTBP09497 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLTBP09497 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLTBP09497 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLTBP09497 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLTBP09497 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CLTBP09497 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLTBP09497 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CLTBP09497 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CLTBP09497 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CLTBP09497 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLTBP09497 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLTBP09497 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLTBP09497 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLTBP09497 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLTBP09497 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLTBP09497 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLTBP09497 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLTBP09497 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLTBP09497 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLTBP09497 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLTBP09497 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLTBP09497 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLTBP09497 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLTBP09497 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLTBP09497 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLTBP09497 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLTBP09497 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLTBP09497 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLTBP09497 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLTBP09497 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLTBP09497 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLTBP09497 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CLTBP09497 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLTBP09497 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLTBP09497 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLTBP09497 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLTBP09497 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLTBP09497 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLTBP09497 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLTBP09497 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CLTBP09497 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLTBP09497 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CLTBP09497 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLTBP09497 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLTBP09497 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLTBP09497 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLTBP09497 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CLTBP09497 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CLTBP09497 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CLTBP09497 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLTBP09497 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLTBP09497 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLTBP09497 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLTBP09497 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLTBP09497 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLTBP09497 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CLTBP09497 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLTBP09497 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLTBP09497 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLTBP09497 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLTBP09497 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLTBP09497 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLTBP09497 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLTBP09497 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLTBP09497 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLTBP09497 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLTBP09497 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLTBP09497 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLTBP09497 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLTBP09497 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLTBP09497 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLTBP09497 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLTBP09497 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLTBP09497 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLTBP09497 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLTBP09497 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLTBP09497 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLTBP09497 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLTBP09497 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLTBP09497 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLTBP09497 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLTBP09497 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLTBP09497 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLTBP09497 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLTBP09497 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CLTBP09497 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CLTBP09497 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLTBP09497 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLTBP09497 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms