Protein–RNA interactions for Protein: P09496

CLTA, Clathrin light chain A, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTAP09496 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CLTAP09496 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CLTAP09496 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLTAP09496 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLTAP09496 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLTAP09496 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLTAP09496 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLTAP09496 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLTAP09496 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLTAP09496 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLTAP09496 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLTAP09496 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLTAP09496 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLTAP09496 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLTAP09496 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLTAP09496 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLTAP09496 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CLTAP09496 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLTAP09496 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLTAP09496 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLTAP09496 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLTAP09496 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLTAP09496 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CLTAP09496 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLTAP09496 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLTAP09496 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLTAP09496 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLTAP09496 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLTAP09496 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLTAP09496 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLTAP09496 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLTAP09496 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLTAP09496 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLTAP09496 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLTAP09496 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLTAP09496 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLTAP09496 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLTAP09496 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLTAP09496 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLTAP09496 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLTAP09496 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLTAP09496 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLTAP09496 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CLTAP09496 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLTAP09496 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLTAP09496 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLTAP09496 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLTAP09496 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLTAP09496 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLTAP09496 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLTAP09496 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLTAP09496 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLTAP09496 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLTAP09496 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLTAP09496 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLTAP09496 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLTAP09496 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLTAP09496 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLTAP09496 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLTAP09496 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLTAP09496 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLTAP09496 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLTAP09496 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLTAP09496 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLTAP09496 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLTAP09496 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLTAP09496 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLTAP09496 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLTAP09496 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CLTAP09496 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CLTAP09496 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CLTAP09496 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLTAP09496 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLTAP09496 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLTAP09496 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLTAP09496 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CLTAP09496 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLTAP09496 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLTAP09496 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLTAP09496 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLTAP09496 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLTAP09496 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLTAP09496 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLTAP09496 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLTAP09496 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLTAP09496 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLTAP09496 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLTAP09496 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CLTAP09496 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLTAP09496 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CLTAP09496 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLTAP09496 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLTAP09496 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLTAP09496 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLTAP09496 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLTAP09496 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CLTAP09496 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLTAP09496 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLTAP09496 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CLTAP09496 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms