Protein–RNA interactions for Protein: P02655

APOC2, Apolipoprotein C-II, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC2P02655 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
APOC2P02655 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
APOC2P02655 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
APOC2P02655 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
APOC2P02655 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
APOC2P02655 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOC2P02655 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOC2P02655 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOC2P02655 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOC2P02655 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
APOC2P02655 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOC2P02655 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOC2P02655 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOC2P02655 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOC2P02655 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
APOC2P02655 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
APOC2P02655 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
APOC2P02655 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOC2P02655 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOC2P02655 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
APOC2P02655 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
APOC2P02655 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
APOC2P02655 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
APOC2P02655 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
APOC2P02655 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
APOC2P02655 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
APOC2P02655 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
APOC2P02655 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
APOC2P02655 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
APOC2P02655 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
APOC2P02655 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOC2P02655 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOC2P02655 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOC2P02655 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOC2P02655 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOC2P02655 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOC2P02655 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
APOC2P02655 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOC2P02655 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
APOC2P02655 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOC2P02655 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOC2P02655 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOC2P02655 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOC2P02655 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOC2P02655 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOC2P02655 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOC2P02655 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOC2P02655 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOC2P02655 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOC2P02655 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOC2P02655 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOC2P02655 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOC2P02655 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOC2P02655 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOC2P02655 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOC2P02655 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOC2P02655 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOC2P02655 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOC2P02655 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOC2P02655 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOC2P02655 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOC2P02655 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOC2P02655 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOC2P02655 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOC2P02655 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOC2P02655 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOC2P02655 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOC2P02655 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOC2P02655 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOC2P02655 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOC2P02655 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOC2P02655 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOC2P02655 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOC2P02655 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOC2P02655 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOC2P02655 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOC2P02655 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOC2P02655 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOC2P02655 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOC2P02655 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOC2P02655 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOC2P02655 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOC2P02655 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
APOC2P02655 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
APOC2P02655 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
APOC2P02655 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
APOC2P02655 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
APOC2P02655 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
APOC2P02655 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
APOC2P02655 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
APOC2P02655 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
APOC2P02655 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOC2P02655 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOC2P02655 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOC2P02655 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOC2P02655 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOC2P02655 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOC2P02655 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOC2P02655 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOC2P02655 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms