Protein–RNA interactions for Protein: P02458

COL2A1, Collagen alpha-1(II) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL2A1P02458 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
COL2A1P02458 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
COL2A1P02458 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
COL2A1P02458 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
COL2A1P02458 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
COL2A1P02458 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
COL2A1P02458 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
COL2A1P02458 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
COL2A1P02458 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
COL2A1P02458 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
COL2A1P02458 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
COL2A1P02458 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
COL2A1P02458 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
COL2A1P02458 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
COL2A1P02458 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
COL2A1P02458 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
COL2A1P02458 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
COL2A1P02458 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
COL2A1P02458 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
COL2A1P02458 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
COL2A1P02458 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
COL2A1P02458 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
COL2A1P02458 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
COL2A1P02458 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
COL2A1P02458 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
COL2A1P02458 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
COL2A1P02458 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
COL2A1P02458 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
COL2A1P02458 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
COL2A1P02458 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
COL2A1P02458 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
COL2A1P02458 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
COL2A1P02458 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
COL2A1P02458 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
COL2A1P02458 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
COL2A1P02458 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
COL2A1P02458 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
COL2A1P02458 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
COL2A1P02458 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
COL2A1P02458 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
COL2A1P02458 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
COL2A1P02458 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
COL2A1P02458 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
COL2A1P02458 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
COL2A1P02458 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
COL2A1P02458 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
COL2A1P02458 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
COL2A1P02458 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
COL2A1P02458 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
COL2A1P02458 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
COL2A1P02458 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
COL2A1P02458 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
COL2A1P02458 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
COL2A1P02458 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
COL2A1P02458 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
COL2A1P02458 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
COL2A1P02458 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
COL2A1P02458 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
COL2A1P02458 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
COL2A1P02458 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
COL2A1P02458 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
COL2A1P02458 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
COL2A1P02458 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
COL2A1P02458 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
COL2A1P02458 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
COL2A1P02458 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
COL2A1P02458 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
COL2A1P02458 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
COL2A1P02458 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
COL2A1P02458 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
COL2A1P02458 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
COL2A1P02458 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
COL2A1P02458 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
COL2A1P02458 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
COL2A1P02458 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
COL2A1P02458 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
COL2A1P02458 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
COL2A1P02458 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
COL2A1P02458 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
COL2A1P02458 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
COL2A1P02458 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
COL2A1P02458 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
COL2A1P02458 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
COL2A1P02458 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
COL2A1P02458 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
COL2A1P02458 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
COL2A1P02458 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
COL2A1P02458 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
COL2A1P02458 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
COL2A1P02458 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
COL2A1P02458 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
COL2A1P02458 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
COL2A1P02458 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
COL2A1P02458 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
COL2A1P02458 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
COL2A1P02458 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
COL2A1P02458 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
COL2A1P02458 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
COL2A1P02458 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
COL2A1P02458 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms