Protein–RNA interactions for Protein: O95460

MATN4, Matrilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MATN4O95460 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MATN4O95460 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MATN4O95460 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MATN4O95460 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MATN4O95460 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MATN4O95460 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MATN4O95460 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MATN4O95460 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MATN4O95460 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MATN4O95460 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MATN4O95460 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MATN4O95460 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MATN4O95460 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MATN4O95460 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MATN4O95460 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MATN4O95460 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MATN4O95460 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MATN4O95460 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MATN4O95460 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MATN4O95460 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MATN4O95460 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MATN4O95460 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MATN4O95460 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MATN4O95460 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MATN4O95460 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MATN4O95460 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MATN4O95460 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MATN4O95460 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MATN4O95460 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MATN4O95460 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MATN4O95460 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MATN4O95460 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MATN4O95460 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MATN4O95460 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MATN4O95460 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MATN4O95460 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MATN4O95460 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MATN4O95460 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MATN4O95460 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MATN4O95460 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MATN4O95460 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MATN4O95460 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MATN4O95460 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MATN4O95460 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MATN4O95460 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MATN4O95460 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MATN4O95460 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MATN4O95460 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MATN4O95460 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MATN4O95460 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MATN4O95460 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MATN4O95460 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MATN4O95460 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MATN4O95460 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MATN4O95460 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MATN4O95460 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MATN4O95460 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MATN4O95460 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MATN4O95460 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MATN4O95460 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MATN4O95460 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MATN4O95460 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MATN4O95460 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MATN4O95460 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MATN4O95460 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MATN4O95460 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MATN4O95460 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MATN4O95460 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MATN4O95460 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MATN4O95460 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MATN4O95460 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MATN4O95460 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MATN4O95460 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MATN4O95460 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MATN4O95460 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MATN4O95460 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MATN4O95460 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MATN4O95460 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MATN4O95460 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MATN4O95460 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MATN4O95460 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MATN4O95460 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MATN4O95460 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MATN4O95460 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MATN4O95460 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MATN4O95460 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MATN4O95460 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MATN4O95460 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MATN4O95460 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MATN4O95460 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MATN4O95460 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MATN4O95460 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MATN4O95460 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MATN4O95460 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MATN4O95460 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MATN4O95460 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MATN4O95460 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MATN4O95460 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MATN4O95460 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MATN4O95460 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 182.9 ms