Protein–RNA interactions for Protein: O95295

SNAPIN, SNARE-associated protein Snapin, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPINO95295 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNAPINO95295 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNAPINO95295 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNAPINO95295 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNAPINO95295 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNAPINO95295 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNAPINO95295 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNAPINO95295 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SNAPINO95295 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNAPINO95295 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNAPINO95295 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNAPINO95295 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNAPINO95295 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNAPINO95295 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNAPINO95295 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNAPINO95295 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNAPINO95295 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNAPINO95295 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNAPINO95295 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNAPINO95295 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNAPINO95295 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNAPINO95295 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNAPINO95295 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNAPINO95295 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SNAPINO95295 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNAPINO95295 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNAPINO95295 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNAPINO95295 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNAPINO95295 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNAPINO95295 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNAPINO95295 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNAPINO95295 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNAPINO95295 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNAPINO95295 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNAPINO95295 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNAPINO95295 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNAPINO95295 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNAPINO95295 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNAPINO95295 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNAPINO95295 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNAPINO95295 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNAPINO95295 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNAPINO95295 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNAPINO95295 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNAPINO95295 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNAPINO95295 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNAPINO95295 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNAPINO95295 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNAPINO95295 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNAPINO95295 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNAPINO95295 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNAPINO95295 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNAPINO95295 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNAPINO95295 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNAPINO95295 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNAPINO95295 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNAPINO95295 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNAPINO95295 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNAPINO95295 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNAPINO95295 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNAPINO95295 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNAPINO95295 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SNAPINO95295 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNAPINO95295 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNAPINO95295 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNAPINO95295 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNAPINO95295 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNAPINO95295 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNAPINO95295 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNAPINO95295 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNAPINO95295 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNAPINO95295 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNAPINO95295 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNAPINO95295 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNAPINO95295 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNAPINO95295 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNAPINO95295 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNAPINO95295 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNAPINO95295 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNAPINO95295 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNAPINO95295 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNAPINO95295 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNAPINO95295 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNAPINO95295 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNAPINO95295 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNAPINO95295 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNAPINO95295 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNAPINO95295 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNAPINO95295 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNAPINO95295 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNAPINO95295 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNAPINO95295 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNAPINO95295 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNAPINO95295 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNAPINO95295 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNAPINO95295 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNAPINO95295 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNAPINO95295 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNAPINO95295 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNAPINO95295 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms