Protein–RNA interactions for Protein: O95248

SBF1, Myotubularin-related protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBF1O95248 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SBF1O95248 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SBF1O95248 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SBF1O95248 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SBF1O95248 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SBF1O95248 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SBF1O95248 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SBF1O95248 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SBF1O95248 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SBF1O95248 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SBF1O95248 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SBF1O95248 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SBF1O95248 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SBF1O95248 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SBF1O95248 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SBF1O95248 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SBF1O95248 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SBF1O95248 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SBF1O95248 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SBF1O95248 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SBF1O95248 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SBF1O95248 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SBF1O95248 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SBF1O95248 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SBF1O95248 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SBF1O95248 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SBF1O95248 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SBF1O95248 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SBF1O95248 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SBF1O95248 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SBF1O95248 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SBF1O95248 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SBF1O95248 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SBF1O95248 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SBF1O95248 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SBF1O95248 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SBF1O95248 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SBF1O95248 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SBF1O95248 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SBF1O95248 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SBF1O95248 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SBF1O95248 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SBF1O95248 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SBF1O95248 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
SBF1O95248 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SBF1O95248 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
SBF1O95248 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SBF1O95248 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SBF1O95248 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SBF1O95248 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SBF1O95248 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SBF1O95248 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SBF1O95248 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SBF1O95248 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SBF1O95248 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SBF1O95248 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SBF1O95248 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SBF1O95248 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SBF1O95248 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SBF1O95248 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SBF1O95248 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SBF1O95248 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SBF1O95248 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SBF1O95248 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SBF1O95248 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SBF1O95248 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SBF1O95248 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SBF1O95248 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SBF1O95248 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SBF1O95248 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SBF1O95248 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SBF1O95248 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SBF1O95248 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SBF1O95248 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SBF1O95248 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SBF1O95248 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SBF1O95248 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SBF1O95248 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SBF1O95248 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SBF1O95248 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SBF1O95248 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SBF1O95248 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SBF1O95248 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SBF1O95248 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SBF1O95248 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SBF1O95248 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SBF1O95248 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SBF1O95248 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SBF1O95248 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SBF1O95248 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SBF1O95248 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SBF1O95248 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SBF1O95248 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SBF1O95248 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SBF1O95248 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SBF1O95248 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SBF1O95248 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SBF1O95248 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SBF1O95248 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SBF1O95248 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133 ms