Protein–RNA interactions for Protein: O94898

LRIG2, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,065 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG2O94898 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRIG2O94898 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRIG2O94898 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRIG2O94898 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRIG2O94898 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRIG2O94898 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRIG2O94898 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRIG2O94898 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRIG2O94898 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRIG2O94898 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRIG2O94898 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRIG2O94898 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRIG2O94898 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRIG2O94898 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRIG2O94898 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRIG2O94898 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRIG2O94898 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRIG2O94898 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRIG2O94898 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRIG2O94898 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRIG2O94898 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
LRIG2O94898 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRIG2O94898 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRIG2O94898 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRIG2O94898 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRIG2O94898 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRIG2O94898 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRIG2O94898 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LRIG2O94898 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LRIG2O94898 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRIG2O94898 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRIG2O94898 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LRIG2O94898 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRIG2O94898 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRIG2O94898 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRIG2O94898 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRIG2O94898 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRIG2O94898 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LRIG2O94898 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRIG2O94898 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRIG2O94898 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LRIG2O94898 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRIG2O94898 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRIG2O94898 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRIG2O94898 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRIG2O94898 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRIG2O94898 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRIG2O94898 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
LRIG2O94898 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRIG2O94898 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRIG2O94898 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRIG2O94898 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRIG2O94898 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRIG2O94898 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRIG2O94898 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRIG2O94898 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
LRIG2O94898 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRIG2O94898 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRIG2O94898 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRIG2O94898 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRIG2O94898 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRIG2O94898 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
LRIG2O94898 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRIG2O94898 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRIG2O94898 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LRIG2O94898 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LRIG2O94898 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LRIG2O94898 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRIG2O94898 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRIG2O94898 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRIG2O94898 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRIG2O94898 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRIG2O94898 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRIG2O94898 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRIG2O94898 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRIG2O94898 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRIG2O94898 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRIG2O94898 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRIG2O94898 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
LRIG2O94898 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRIG2O94898 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRIG2O94898 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRIG2O94898 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRIG2O94898 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRIG2O94898 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRIG2O94898 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRIG2O94898 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
LRIG2O94898 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRIG2O94898 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
LRIG2O94898 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
LRIG2O94898 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
LRIG2O94898 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
LRIG2O94898 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRIG2O94898 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRIG2O94898 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRIG2O94898 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRIG2O94898 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRIG2O94898 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRIG2O94898 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRIG2O94898 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms