Protein–RNA interactions for Protein: O94886

TMEM63A, CSC1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 807 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM63AO94886 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM63AO94886 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM63AO94886 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM63AO94886 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM63AO94886 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM63AO94886 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM63AO94886 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM63AO94886 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM63AO94886 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM63AO94886 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM63AO94886 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM63AO94886 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM63AO94886 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM63AO94886 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM63AO94886 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM63AO94886 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TMEM63AO94886 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TMEM63AO94886 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TMEM63AO94886 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TMEM63AO94886 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM63AO94886 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM63AO94886 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM63AO94886 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM63AO94886 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM63AO94886 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM63AO94886 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM63AO94886 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM63AO94886 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM63AO94886 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM63AO94886 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM63AO94886 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM63AO94886 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM63AO94886 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM63AO94886 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM63AO94886 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM63AO94886 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM63AO94886 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM63AO94886 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM63AO94886 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM63AO94886 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM63AO94886 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM63AO94886 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM63AO94886 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM63AO94886 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM63AO94886 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM63AO94886 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM63AO94886 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM63AO94886 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM63AO94886 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM63AO94886 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM63AO94886 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM63AO94886 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM63AO94886 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM63AO94886 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM63AO94886 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM63AO94886 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM63AO94886 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM63AO94886 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM63AO94886 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM63AO94886 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM63AO94886 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM63AO94886 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM63AO94886 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM63AO94886 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM63AO94886 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM63AO94886 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM63AO94886 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM63AO94886 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM63AO94886 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM63AO94886 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM63AO94886 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM63AO94886 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM63AO94886 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM63AO94886 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM63AO94886 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM63AO94886 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM63AO94886 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TMEM63AO94886 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TMEM63AO94886 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM63AO94886 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM63AO94886 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM63AO94886 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM63AO94886 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM63AO94886 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM63AO94886 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM63AO94886 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM63AO94886 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM63AO94886 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM63AO94886 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM63AO94886 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM63AO94886 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM63AO94886 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM63AO94886 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM63AO94886 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM63AO94886 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM63AO94886 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM63AO94886 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM63AO94886 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM63AO94886 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM63AO94886 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms