Protein–RNA interactions for Protein: O76015

KRT38, Keratin, type I cuticular Ha8, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT38O76015 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT38O76015 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT38O76015 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT38O76015 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT38O76015 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT38O76015 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT38O76015 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT38O76015 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT38O76015 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT38O76015 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT38O76015 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT38O76015 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT38O76015 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT38O76015 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT38O76015 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT38O76015 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT38O76015 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT38O76015 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT38O76015 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT38O76015 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT38O76015 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT38O76015 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT38O76015 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT38O76015 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT38O76015 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT38O76015 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT38O76015 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT38O76015 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT38O76015 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT38O76015 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT38O76015 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT38O76015 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT38O76015 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT38O76015 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT38O76015 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
KRT38O76015 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
KRT38O76015 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
KRT38O76015 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT38O76015 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT38O76015 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT38O76015 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT38O76015 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT38O76015 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT38O76015 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT38O76015 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT38O76015 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT38O76015 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT38O76015 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT38O76015 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT38O76015 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT38O76015 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT38O76015 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT38O76015 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT38O76015 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT38O76015 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT38O76015 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT38O76015 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT38O76015 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT38O76015 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT38O76015 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT38O76015 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT38O76015 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT38O76015 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT38O76015 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT38O76015 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT38O76015 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT38O76015 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT38O76015 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT38O76015 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT38O76015 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT38O76015 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT38O76015 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT38O76015 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT38O76015 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT38O76015 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT38O76015 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT38O76015 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT38O76015 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT38O76015 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT38O76015 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT38O76015 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT38O76015 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT38O76015 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT38O76015 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT38O76015 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT38O76015 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT38O76015 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT38O76015 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT38O76015 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT38O76015 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT38O76015 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT38O76015 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT38O76015 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT38O76015 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT38O76015 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT38O76015 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT38O76015 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT38O76015 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT38O76015 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT38O76015 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms