Protein–RNA interactions for Protein: O75154

RAB11FIP3, Rab11 family-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP3O75154 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RAB11FIP3O75154 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RAB11FIP3O75154 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RAB11FIP3O75154 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RAB11FIP3O75154 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RAB11FIP3O75154 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RAB11FIP3O75154 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RAB11FIP3O75154 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RAB11FIP3O75154 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RAB11FIP3O75154 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RAB11FIP3O75154 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RAB11FIP3O75154 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RAB11FIP3O75154 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RAB11FIP3O75154 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RAB11FIP3O75154 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RAB11FIP3O75154 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RAB11FIP3O75154 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RAB11FIP3O75154 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RAB11FIP3O75154 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RAB11FIP3O75154 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RAB11FIP3O75154 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RAB11FIP3O75154 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RAB11FIP3O75154 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
RAB11FIP3O75154 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RAB11FIP3O75154 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RAB11FIP3O75154 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RAB11FIP3O75154 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RAB11FIP3O75154 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RAB11FIP3O75154 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RAB11FIP3O75154 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RAB11FIP3O75154 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RAB11FIP3O75154 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RAB11FIP3O75154 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
RAB11FIP3O75154 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
RAB11FIP3O75154 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RAB11FIP3O75154 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
RAB11FIP3O75154 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
RAB11FIP3O75154 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
RAB11FIP3O75154 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
RAB11FIP3O75154 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
RAB11FIP3O75154 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RAB11FIP3O75154 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RAB11FIP3O75154 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RAB11FIP3O75154 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RAB11FIP3O75154 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
RAB11FIP3O75154 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
RAB11FIP3O75154 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
RAB11FIP3O75154 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RAB11FIP3O75154 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RAB11FIP3O75154 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RAB11FIP3O75154 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RAB11FIP3O75154 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RAB11FIP3O75154 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RAB11FIP3O75154 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RAB11FIP3O75154 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RAB11FIP3O75154 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RAB11FIP3O75154 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RAB11FIP3O75154 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RAB11FIP3O75154 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RAB11FIP3O75154 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RAB11FIP3O75154 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RAB11FIP3O75154 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RAB11FIP3O75154 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RAB11FIP3O75154 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RAB11FIP3O75154 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RAB11FIP3O75154 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RAB11FIP3O75154 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RAB11FIP3O75154 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RAB11FIP3O75154 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RAB11FIP3O75154 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RAB11FIP3O75154 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
RAB11FIP3O75154 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RAB11FIP3O75154 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RAB11FIP3O75154 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RAB11FIP3O75154 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RAB11FIP3O75154 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RAB11FIP3O75154 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RAB11FIP3O75154 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RAB11FIP3O75154 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAB11FIP3O75154 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAB11FIP3O75154 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAB11FIP3O75154 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAB11FIP3O75154 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAB11FIP3O75154 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAB11FIP3O75154 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAB11FIP3O75154 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAB11FIP3O75154 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
RAB11FIP3O75154 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAB11FIP3O75154 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAB11FIP3O75154 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAB11FIP3O75154 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAB11FIP3O75154 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RAB11FIP3O75154 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RAB11FIP3O75154 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RAB11FIP3O75154 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
RAB11FIP3O75154 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RAB11FIP3O75154 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RAB11FIP3O75154 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RAB11FIP3O75154 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RAB11FIP3O75154 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms