Protein–RNA interactions for Protein: O75074

LRP3, Low-density lipoprotein receptor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP3O75074 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRP3O75074 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRP3O75074 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRP3O75074 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRP3O75074 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRP3O75074 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRP3O75074 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRP3O75074 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRP3O75074 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRP3O75074 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRP3O75074 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRP3O75074 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRP3O75074 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRP3O75074 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRP3O75074 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRP3O75074 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LRP3O75074 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRP3O75074 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LRP3O75074 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRP3O75074 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRP3O75074 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRP3O75074 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRP3O75074 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRP3O75074 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRP3O75074 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRP3O75074 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRP3O75074 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRP3O75074 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRP3O75074 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LRP3O75074 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRP3O75074 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRP3O75074 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRP3O75074 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRP3O75074 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRP3O75074 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRP3O75074 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRP3O75074 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRP3O75074 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRP3O75074 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRP3O75074 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRP3O75074 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRP3O75074 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRP3O75074 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRP3O75074 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LRP3O75074 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRP3O75074 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRP3O75074 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LRP3O75074 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRP3O75074 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRP3O75074 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LRP3O75074 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRP3O75074 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRP3O75074 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRP3O75074 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRP3O75074 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRP3O75074 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRP3O75074 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LRP3O75074 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRP3O75074 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRP3O75074 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRP3O75074 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LRP3O75074 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRP3O75074 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRP3O75074 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LRP3O75074 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRP3O75074 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LRP3O75074 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRP3O75074 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRP3O75074 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRP3O75074 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LRP3O75074 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRP3O75074 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRP3O75074 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRP3O75074 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRP3O75074 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRP3O75074 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRP3O75074 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LRP3O75074 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRP3O75074 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRP3O75074 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRP3O75074 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRP3O75074 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRP3O75074 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRP3O75074 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRP3O75074 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRP3O75074 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRP3O75074 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRP3O75074 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRP3O75074 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRP3O75074 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRP3O75074 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRP3O75074 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRP3O75074 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRP3O75074 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRP3O75074 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRP3O75074 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRP3O75074 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRP3O75074 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRP3O75074 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRP3O75074 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms