Protein–RNA interactions for Protein: O43508

TNFSF12, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 12, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF12O43508 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TNFSF12O43508 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TNFSF12O43508 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TNFSF12O43508 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TNFSF12O43508 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TNFSF12O43508 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TNFSF12O43508 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TNFSF12O43508 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TNFSF12O43508 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TNFSF12O43508 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TNFSF12O43508 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TNFSF12O43508 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TNFSF12O43508 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TNFSF12O43508 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TNFSF12O43508 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TNFSF12O43508 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TNFSF12O43508 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TNFSF12O43508 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TNFSF12O43508 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TNFSF12O43508 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TNFSF12O43508 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TNFSF12O43508 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TNFSF12O43508 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TNFSF12O43508 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TNFSF12O43508 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TNFSF12O43508 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TNFSF12O43508 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TNFSF12O43508 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TNFSF12O43508 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TNFSF12O43508 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TNFSF12O43508 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TNFSF12O43508 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TNFSF12O43508 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TNFSF12O43508 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TNFSF12O43508 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TNFSF12O43508 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TNFSF12O43508 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TNFSF12O43508 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TNFSF12O43508 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TNFSF12O43508 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNFSF12O43508 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNFSF12O43508 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TNFSF12O43508 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNFSF12O43508 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNFSF12O43508 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNFSF12O43508 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNFSF12O43508 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNFSF12O43508 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNFSF12O43508 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TNFSF12O43508 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TNFSF12O43508 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TNFSF12O43508 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TNFSF12O43508 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TNFSF12O43508 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TNFSF12O43508 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TNFSF12O43508 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TNFSF12O43508 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TNFSF12O43508 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNFSF12O43508 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNFSF12O43508 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNFSF12O43508 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNFSF12O43508 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNFSF12O43508 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNFSF12O43508 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNFSF12O43508 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNFSF12O43508 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNFSF12O43508 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNFSF12O43508 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TNFSF12O43508 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNFSF12O43508 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNFSF12O43508 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNFSF12O43508 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNFSF12O43508 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNFSF12O43508 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFSF12O43508 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFSF12O43508 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFSF12O43508 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFSF12O43508 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFSF12O43508 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFSF12O43508 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFSF12O43508 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFSF12O43508 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFSF12O43508 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFSF12O43508 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFSF12O43508 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFSF12O43508 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFSF12O43508 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFSF12O43508 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFSF12O43508 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFSF12O43508 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF12O43508 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF12O43508 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF12O43508 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF12O43508 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF12O43508 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF12O43508 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF12O43508 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF12O43508 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF12O43508 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF12O43508 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.4 ms