Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTIFO43310 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTIFO43310 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CTIFO43310 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTIFO43310 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTIFO43310 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTIFO43310 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CTIFO43310 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CTIFO43310 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CTIFO43310 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CTIFO43310 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CTIFO43310 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CTIFO43310 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CTIFO43310 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CTIFO43310 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CTIFO43310 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
CTIFO43310 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
CTIFO43310 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CTIFO43310 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CTIFO43310 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTIFO43310 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTIFO43310 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTIFO43310 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTIFO43310 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTIFO43310 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTIFO43310 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTIFO43310 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTIFO43310 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTIFO43310 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTIFO43310 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTIFO43310 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTIFO43310 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTIFO43310 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTIFO43310 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTIFO43310 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTIFO43310 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTIFO43310 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTIFO43310 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTIFO43310 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTIFO43310 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTIFO43310 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTIFO43310 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTIFO43310 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTIFO43310 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTIFO43310 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTIFO43310 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTIFO43310 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTIFO43310 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTIFO43310 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTIFO43310 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTIFO43310 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTIFO43310 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CTIFO43310 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTIFO43310 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTIFO43310 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTIFO43310 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTIFO43310 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTIFO43310 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTIFO43310 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTIFO43310 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTIFO43310 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTIFO43310 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTIFO43310 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTIFO43310 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTIFO43310 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTIFO43310 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTIFO43310 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTIFO43310 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTIFO43310 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTIFO43310 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTIFO43310 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTIFO43310 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTIFO43310 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTIFO43310 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CTIFO43310 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CTIFO43310 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CTIFO43310 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CTIFO43310 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CTIFO43310 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CTIFO43310 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CTIFO43310 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CTIFO43310 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CTIFO43310 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CTIFO43310 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CTIFO43310 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CTIFO43310 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTIFO43310 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTIFO43310 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTIFO43310 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTIFO43310 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTIFO43310 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTIFO43310 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTIFO43310 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTIFO43310 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTIFO43310 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CTIFO43310 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTIFO43310 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTIFO43310 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTIFO43310 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTIFO43310 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
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