Protein–RNA interactions for Protein: O15232

MATN3, Matrilin-3, humanhuman

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MATN3O15232 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MATN3O15232 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MATN3O15232 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MATN3O15232 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MATN3O15232 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MATN3O15232 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MATN3O15232 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MATN3O15232 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MATN3O15232 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MATN3O15232 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MATN3O15232 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MATN3O15232 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MATN3O15232 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MATN3O15232 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MATN3O15232 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MATN3O15232 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MATN3O15232 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MATN3O15232 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MATN3O15232 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MATN3O15232 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MATN3O15232 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MATN3O15232 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MATN3O15232 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MATN3O15232 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MATN3O15232 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MATN3O15232 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MATN3O15232 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MATN3O15232 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MATN3O15232 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MATN3O15232 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MATN3O15232 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MATN3O15232 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MATN3O15232 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MATN3O15232 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MATN3O15232 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MATN3O15232 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MATN3O15232 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MATN3O15232 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MATN3O15232 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MATN3O15232 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MATN3O15232 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MATN3O15232 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MATN3O15232 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MATN3O15232 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MATN3O15232 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MATN3O15232 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MATN3O15232 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MATN3O15232 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MATN3O15232 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MATN3O15232 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MATN3O15232 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MATN3O15232 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MATN3O15232 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MATN3O15232 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MATN3O15232 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MATN3O15232 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MATN3O15232 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MATN3O15232 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MATN3O15232 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MATN3O15232 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MATN3O15232 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MATN3O15232 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MATN3O15232 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MATN3O15232 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MATN3O15232 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MATN3O15232 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MATN3O15232 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MATN3O15232 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MATN3O15232 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MATN3O15232 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MATN3O15232 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MATN3O15232 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MATN3O15232 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MATN3O15232 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MATN3O15232 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MATN3O15232 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MATN3O15232 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MATN3O15232 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MATN3O15232 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MATN3O15232 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MATN3O15232 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MATN3O15232 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MATN3O15232 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MATN3O15232 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MATN3O15232 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MATN3O15232 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MATN3O15232 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MATN3O15232 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MATN3O15232 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MATN3O15232 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MATN3O15232 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MATN3O15232 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MATN3O15232 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MATN3O15232 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MATN3O15232 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MATN3O15232 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MATN3O15232 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MATN3O15232 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MATN3O15232 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MATN3O15232 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms