Protein–RNA interactions for Protein: O15197

EPHB6, Ephrin type-B receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB6O15197 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EPHB6O15197 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
EPHB6O15197 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EPHB6O15197 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EPHB6O15197 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EPHB6O15197 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EPHB6O15197 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EPHB6O15197 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EPHB6O15197 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EPHB6O15197 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EPHB6O15197 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EPHB6O15197 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EPHB6O15197 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EPHB6O15197 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EPHB6O15197 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EPHB6O15197 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EPHB6O15197 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EPHB6O15197 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EPHB6O15197 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EPHB6O15197 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EPHB6O15197 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EPHB6O15197 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EPHB6O15197 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EPHB6O15197 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EPHB6O15197 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EPHB6O15197 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EPHB6O15197 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EPHB6O15197 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EPHB6O15197 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EPHB6O15197 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EPHB6O15197 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EPHB6O15197 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EPHB6O15197 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EPHB6O15197 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EPHB6O15197 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EPHB6O15197 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EPHB6O15197 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EPHB6O15197 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EPHB6O15197 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EPHB6O15197 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EPHB6O15197 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EPHB6O15197 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EPHB6O15197 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EPHB6O15197 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EPHB6O15197 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EPHB6O15197 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EPHB6O15197 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EPHB6O15197 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EPHB6O15197 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EPHB6O15197 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EPHB6O15197 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EPHB6O15197 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
EPHB6O15197 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
EPHB6O15197 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EPHB6O15197 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
EPHB6O15197 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EPHB6O15197 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EPHB6O15197 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EPHB6O15197 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EPHB6O15197 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EPHB6O15197 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EPHB6O15197 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EPHB6O15197 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EPHB6O15197 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EPHB6O15197 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EPHB6O15197 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EPHB6O15197 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EPHB6O15197 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EPHB6O15197 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EPHB6O15197 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EPHB6O15197 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EPHB6O15197 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EPHB6O15197 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EPHB6O15197 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EPHB6O15197 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EPHB6O15197 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EPHB6O15197 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EPHB6O15197 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EPHB6O15197 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EPHB6O15197 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EPHB6O15197 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EPHB6O15197 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
EPHB6O15197 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EPHB6O15197 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EPHB6O15197 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EPHB6O15197 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EPHB6O15197 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EPHB6O15197 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EPHB6O15197 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EPHB6O15197 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EPHB6O15197 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EPHB6O15197 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EPHB6O15197 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EPHB6O15197 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EPHB6O15197 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EPHB6O15197 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EPHB6O15197 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EPHB6O15197 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EPHB6O15197 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EPHB6O15197 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms