Protein–RNA interactions for Protein: O15075

DCLK1, Serine/threonine-protein kinase DCLK1, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLK1O15075 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DCLK1O15075 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DCLK1O15075 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
DCLK1O15075 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DCLK1O15075 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DCLK1O15075 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DCLK1O15075 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DCLK1O15075 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
DCLK1O15075 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DCLK1O15075 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
DCLK1O15075 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DCLK1O15075 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DCLK1O15075 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DCLK1O15075 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DCLK1O15075 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DCLK1O15075 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DCLK1O15075 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DCLK1O15075 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DCLK1O15075 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DCLK1O15075 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DCLK1O15075 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DCLK1O15075 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DCLK1O15075 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DCLK1O15075 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DCLK1O15075 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DCLK1O15075 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
DCLK1O15075 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DCLK1O15075 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DCLK1O15075 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DCLK1O15075 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
DCLK1O15075 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DCLK1O15075 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DCLK1O15075 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DCLK1O15075 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
DCLK1O15075 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DCLK1O15075 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
DCLK1O15075 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DCLK1O15075 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DCLK1O15075 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DCLK1O15075 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DCLK1O15075 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DCLK1O15075 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DCLK1O15075 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DCLK1O15075 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DCLK1O15075 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DCLK1O15075 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DCLK1O15075 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DCLK1O15075 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DCLK1O15075 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DCLK1O15075 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DCLK1O15075 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DCLK1O15075 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DCLK1O15075 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DCLK1O15075 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
DCLK1O15075 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DCLK1O15075 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DCLK1O15075 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DCLK1O15075 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DCLK1O15075 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DCLK1O15075 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DCLK1O15075 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DCLK1O15075 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DCLK1O15075 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DCLK1O15075 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DCLK1O15075 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DCLK1O15075 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DCLK1O15075 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DCLK1O15075 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DCLK1O15075 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DCLK1O15075 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DCLK1O15075 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DCLK1O15075 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DCLK1O15075 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DCLK1O15075 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DCLK1O15075 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DCLK1O15075 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DCLK1O15075 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
DCLK1O15075 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DCLK1O15075 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DCLK1O15075 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DCLK1O15075 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DCLK1O15075 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DCLK1O15075 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DCLK1O15075 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DCLK1O15075 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DCLK1O15075 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DCLK1O15075 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DCLK1O15075 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DCLK1O15075 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DCLK1O15075 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DCLK1O15075 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DCLK1O15075 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DCLK1O15075 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DCLK1O15075 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DCLK1O15075 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DCLK1O15075 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DCLK1O15075 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DCLK1O15075 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DCLK1O15075 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
DCLK1O15075 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms