Protein–RNA interactions for Protein: O14828

SCAMP3, Secretory carrier-associated membrane protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP3O14828 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCAMP3O14828 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCAMP3O14828 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCAMP3O14828 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCAMP3O14828 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCAMP3O14828 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCAMP3O14828 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCAMP3O14828 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCAMP3O14828 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCAMP3O14828 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCAMP3O14828 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SCAMP3O14828 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCAMP3O14828 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCAMP3O14828 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SCAMP3O14828 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCAMP3O14828 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCAMP3O14828 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCAMP3O14828 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCAMP3O14828 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCAMP3O14828 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCAMP3O14828 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCAMP3O14828 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SCAMP3O14828 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCAMP3O14828 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCAMP3O14828 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCAMP3O14828 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCAMP3O14828 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCAMP3O14828 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCAMP3O14828 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCAMP3O14828 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCAMP3O14828 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCAMP3O14828 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCAMP3O14828 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCAMP3O14828 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCAMP3O14828 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCAMP3O14828 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCAMP3O14828 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCAMP3O14828 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCAMP3O14828 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCAMP3O14828 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SCAMP3O14828 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCAMP3O14828 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCAMP3O14828 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCAMP3O14828 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCAMP3O14828 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCAMP3O14828 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SCAMP3O14828 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCAMP3O14828 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SCAMP3O14828 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCAMP3O14828 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCAMP3O14828 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCAMP3O14828 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCAMP3O14828 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCAMP3O14828 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCAMP3O14828 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCAMP3O14828 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCAMP3O14828 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCAMP3O14828 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCAMP3O14828 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCAMP3O14828 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCAMP3O14828 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCAMP3O14828 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCAMP3O14828 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCAMP3O14828 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCAMP3O14828 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCAMP3O14828 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCAMP3O14828 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCAMP3O14828 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCAMP3O14828 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCAMP3O14828 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCAMP3O14828 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCAMP3O14828 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCAMP3O14828 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCAMP3O14828 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCAMP3O14828 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCAMP3O14828 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SCAMP3O14828 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCAMP3O14828 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCAMP3O14828 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCAMP3O14828 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCAMP3O14828 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCAMP3O14828 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCAMP3O14828 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCAMP3O14828 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCAMP3O14828 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCAMP3O14828 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCAMP3O14828 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SCAMP3O14828 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SCAMP3O14828 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCAMP3O14828 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCAMP3O14828 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCAMP3O14828 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCAMP3O14828 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCAMP3O14828 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
SCAMP3O14828 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SCAMP3O14828 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCAMP3O14828 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCAMP3O14828 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCAMP3O14828 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCAMP3O14828 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms