Protein–RNA interactions for Protein: O14579

COPE, Coatomer subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPEO14579 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COPEO14579 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COPEO14579 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COPEO14579 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COPEO14579 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COPEO14579 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COPEO14579 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COPEO14579 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COPEO14579 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COPEO14579 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COPEO14579 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COPEO14579 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COPEO14579 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COPEO14579 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COPEO14579 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COPEO14579 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COPEO14579 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COPEO14579 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COPEO14579 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COPEO14579 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COPEO14579 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COPEO14579 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COPEO14579 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COPEO14579 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COPEO14579 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COPEO14579 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COPEO14579 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COPEO14579 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COPEO14579 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COPEO14579 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COPEO14579 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COPEO14579 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COPEO14579 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COPEO14579 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COPEO14579 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COPEO14579 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COPEO14579 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COPEO14579 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
COPEO14579 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COPEO14579 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COPEO14579 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COPEO14579 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COPEO14579 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COPEO14579 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COPEO14579 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COPEO14579 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COPEO14579 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COPEO14579 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COPEO14579 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COPEO14579 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
COPEO14579 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
COPEO14579 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
COPEO14579 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
COPEO14579 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPEO14579 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPEO14579 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPEO14579 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPEO14579 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPEO14579 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPEO14579 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPEO14579 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPEO14579 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPEO14579 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPEO14579 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COPEO14579 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COPEO14579 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COPEO14579 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COPEO14579 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COPEO14579 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
COPEO14579 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COPEO14579 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
COPEO14579 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COPEO14579 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COPEO14579 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COPEO14579 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COPEO14579 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COPEO14579 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COPEO14579 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COPEO14579 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COPEO14579 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COPEO14579 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COPEO14579 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COPEO14579 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COPEO14579 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COPEO14579 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COPEO14579 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COPEO14579 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COPEO14579 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COPEO14579 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COPEO14579 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COPEO14579 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COPEO14579 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COPEO14579 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COPEO14579 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COPEO14579 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COPEO14579 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COPEO14579 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COPEO14579 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COPEO14579 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COPEO14579 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms