Protein–RNA interactions for Protein: O14558

HSPB6, Heat shock protein beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB6O14558 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HSPB6O14558 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HSPB6O14558 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HSPB6O14558 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HSPB6O14558 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HSPB6O14558 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HSPB6O14558 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HSPB6O14558 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HSPB6O14558 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HSPB6O14558 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HSPB6O14558 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HSPB6O14558 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HSPB6O14558 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HSPB6O14558 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HSPB6O14558 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HSPB6O14558 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HSPB6O14558 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HSPB6O14558 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HSPB6O14558 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HSPB6O14558 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HSPB6O14558 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HSPB6O14558 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HSPB6O14558 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HSPB6O14558 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HSPB6O14558 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HSPB6O14558 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HSPB6O14558 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HSPB6O14558 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HSPB6O14558 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HSPB6O14558 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HSPB6O14558 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HSPB6O14558 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HSPB6O14558 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HSPB6O14558 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HSPB6O14558 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HSPB6O14558 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HSPB6O14558 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
HSPB6O14558 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HSPB6O14558 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HSPB6O14558 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HSPB6O14558 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HSPB6O14558 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HSPB6O14558 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HSPB6O14558 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HSPB6O14558 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HSPB6O14558 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HSPB6O14558 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HSPB6O14558 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HSPB6O14558 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
HSPB6O14558 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HSPB6O14558 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
HSPB6O14558 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HSPB6O14558 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HSPB6O14558 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HSPB6O14558 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HSPB6O14558 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HSPB6O14558 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HSPB6O14558 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HSPB6O14558 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HSPB6O14558 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HSPB6O14558 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HSPB6O14558 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HSPB6O14558 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HSPB6O14558 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HSPB6O14558 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HSPB6O14558 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HSPB6O14558 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HSPB6O14558 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HSPB6O14558 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HSPB6O14558 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HSPB6O14558 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HSPB6O14558 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HSPB6O14558 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HSPB6O14558 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HSPB6O14558 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HSPB6O14558 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HSPB6O14558 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HSPB6O14558 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HSPB6O14558 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HSPB6O14558 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HSPB6O14558 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HSPB6O14558 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HSPB6O14558 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HSPB6O14558 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HSPB6O14558 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HSPB6O14558 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HSPB6O14558 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HSPB6O14558 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HSPB6O14558 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HSPB6O14558 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HSPB6O14558 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HSPB6O14558 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
HSPB6O14558 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HSPB6O14558 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HSPB6O14558 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HSPB6O14558 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HSPB6O14558 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HSPB6O14558 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HSPB6O14558 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
HSPB6O14558 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms