Protein–RNA interactions for Protein: O00161

SNAP23, Synaptosomal-associated protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23O00161 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SNAP23O00161 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SNAP23O00161 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SNAP23O00161 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SNAP23O00161 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SNAP23O00161 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SNAP23O00161 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SNAP23O00161 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SNAP23O00161 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SNAP23O00161 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SNAP23O00161 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SNAP23O00161 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SNAP23O00161 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SNAP23O00161 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SNAP23O00161 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SNAP23O00161 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SNAP23O00161 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SNAP23O00161 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SNAP23O00161 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SNAP23O00161 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SNAP23O00161 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SNAP23O00161 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SNAP23O00161 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SNAP23O00161 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SNAP23O00161 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SNAP23O00161 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SNAP23O00161 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SNAP23O00161 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SNAP23O00161 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SNAP23O00161 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SNAP23O00161 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SNAP23O00161 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SNAP23O00161 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SNAP23O00161 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
SNAP23O00161 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SNAP23O00161 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SNAP23O00161 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SNAP23O00161 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SNAP23O00161 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SNAP23O00161 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SNAP23O00161 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SNAP23O00161 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SNAP23O00161 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SNAP23O00161 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SNAP23O00161 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SNAP23O00161 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SNAP23O00161 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SNAP23O00161 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SNAP23O00161 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SNAP23O00161 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SNAP23O00161 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SNAP23O00161 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SNAP23O00161 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SNAP23O00161 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SNAP23O00161 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SNAP23O00161 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SNAP23O00161 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SNAP23O00161 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SNAP23O00161 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SNAP23O00161 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SNAP23O00161 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SNAP23O00161 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SNAP23O00161 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SNAP23O00161 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SNAP23O00161 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SNAP23O00161 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SNAP23O00161 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SNAP23O00161 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SNAP23O00161 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SNAP23O00161 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SNAP23O00161 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SNAP23O00161 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SNAP23O00161 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SNAP23O00161 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SNAP23O00161 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SNAP23O00161 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SNAP23O00161 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SNAP23O00161 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SNAP23O00161 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SNAP23O00161 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SNAP23O00161 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SNAP23O00161 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SNAP23O00161 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SNAP23O00161 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SNAP23O00161 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SNAP23O00161 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SNAP23O00161 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SNAP23O00161 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SNAP23O00161 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SNAP23O00161 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SNAP23O00161 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
SNAP23O00161 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SNAP23O00161 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SNAP23O00161 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SNAP23O00161 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SNAP23O00161 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SNAP23O00161 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SNAP23O00161 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SNAP23O00161 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SNAP23O00161 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms