Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
APOC4-APOC2K7ER74 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
APOC4-APOC2K7ER74 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
APOC4-APOC2K7ER74 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
APOC4-APOC2K7ER74 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOC4-APOC2K7ER74 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOC4-APOC2K7ER74 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOC4-APOC2K7ER74 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOC4-APOC2K7ER74 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
APOC4-APOC2K7ER74 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOC4-APOC2K7ER74 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOC4-APOC2K7ER74 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOC4-APOC2K7ER74 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOC4-APOC2K7ER74 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
APOC4-APOC2K7ER74 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
APOC4-APOC2K7ER74 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
APOC4-APOC2K7ER74 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOC4-APOC2K7ER74 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOC4-APOC2K7ER74 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
APOC4-APOC2K7ER74 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
APOC4-APOC2K7ER74 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
APOC4-APOC2K7ER74 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
APOC4-APOC2K7ER74 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
APOC4-APOC2K7ER74 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
APOC4-APOC2K7ER74 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
APOC4-APOC2K7ER74 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
APOC4-APOC2K7ER74 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
APOC4-APOC2K7ER74 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
APOC4-APOC2K7ER74 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOC4-APOC2K7ER74 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOC4-APOC2K7ER74 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOC4-APOC2K7ER74 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOC4-APOC2K7ER74 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOC4-APOC2K7ER74 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOC4-APOC2K7ER74 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
APOC4-APOC2K7ER74 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOC4-APOC2K7ER74 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
APOC4-APOC2K7ER74 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOC4-APOC2K7ER74 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOC4-APOC2K7ER74 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOC4-APOC2K7ER74 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOC4-APOC2K7ER74 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOC4-APOC2K7ER74 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOC4-APOC2K7ER74 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOC4-APOC2K7ER74 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOC4-APOC2K7ER74 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOC4-APOC2K7ER74 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOC4-APOC2K7ER74 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOC4-APOC2K7ER74 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOC4-APOC2K7ER74 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOC4-APOC2K7ER74 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOC4-APOC2K7ER74 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOC4-APOC2K7ER74 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOC4-APOC2K7ER74 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOC4-APOC2K7ER74 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOC4-APOC2K7ER74 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOC4-APOC2K7ER74 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOC4-APOC2K7ER74 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOC4-APOC2K7ER74 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOC4-APOC2K7ER74 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOC4-APOC2K7ER74 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOC4-APOC2K7ER74 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOC4-APOC2K7ER74 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOC4-APOC2K7ER74 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOC4-APOC2K7ER74 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOC4-APOC2K7ER74 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOC4-APOC2K7ER74 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOC4-APOC2K7ER74 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOC4-APOC2K7ER74 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOC4-APOC2K7ER74 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOC4-APOC2K7ER74 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOC4-APOC2K7ER74 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOC4-APOC2K7ER74 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOC4-APOC2K7ER74 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOC4-APOC2K7ER74 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOC4-APOC2K7ER74 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOC4-APOC2K7ER74 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOC4-APOC2K7ER74 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOC4-APOC2K7ER74 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
APOC4-APOC2K7ER74 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
APOC4-APOC2K7ER74 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
APOC4-APOC2K7ER74 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
APOC4-APOC2K7ER74 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
APOC4-APOC2K7ER74 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
APOC4-APOC2K7ER74 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
APOC4-APOC2K7ER74 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
APOC4-APOC2K7ER74 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
APOC4-APOC2K7ER74 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOC4-APOC2K7ER74 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOC4-APOC2K7ER74 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOC4-APOC2K7ER74 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOC4-APOC2K7ER74 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOC4-APOC2K7ER74 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOC4-APOC2K7ER74 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOC4-APOC2K7ER74 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOC4-APOC2K7ER74 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms