Protein–RNA interactions for Protein: K7EJ46

SMIM22, Small integral membrane protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM22K7EJ46 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SMIM22K7EJ46 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SMIM22K7EJ46 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SMIM22K7EJ46 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SMIM22K7EJ46 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SMIM22K7EJ46 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SMIM22K7EJ46 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SMIM22K7EJ46 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SMIM22K7EJ46 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SMIM22K7EJ46 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SMIM22K7EJ46 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SMIM22K7EJ46 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SMIM22K7EJ46 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SMIM22K7EJ46 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SMIM22K7EJ46 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SMIM22K7EJ46 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SMIM22K7EJ46 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SMIM22K7EJ46 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SMIM22K7EJ46 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SMIM22K7EJ46 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMIM22K7EJ46 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMIM22K7EJ46 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMIM22K7EJ46 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMIM22K7EJ46 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMIM22K7EJ46 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMIM22K7EJ46 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMIM22K7EJ46 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMIM22K7EJ46 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMIM22K7EJ46 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMIM22K7EJ46 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMIM22K7EJ46 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMIM22K7EJ46 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMIM22K7EJ46 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMIM22K7EJ46 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMIM22K7EJ46 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMIM22K7EJ46 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMIM22K7EJ46 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SMIM22K7EJ46 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SMIM22K7EJ46 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMIM22K7EJ46 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMIM22K7EJ46 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMIM22K7EJ46 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMIM22K7EJ46 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMIM22K7EJ46 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMIM22K7EJ46 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMIM22K7EJ46 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMIM22K7EJ46 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMIM22K7EJ46 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMIM22K7EJ46 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMIM22K7EJ46 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMIM22K7EJ46 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMIM22K7EJ46 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMIM22K7EJ46 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMIM22K7EJ46 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMIM22K7EJ46 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMIM22K7EJ46 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SMIM22K7EJ46 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SMIM22K7EJ46 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMIM22K7EJ46 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMIM22K7EJ46 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMIM22K7EJ46 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMIM22K7EJ46 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMIM22K7EJ46 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMIM22K7EJ46 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
SMIM22K7EJ46 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMIM22K7EJ46 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMIM22K7EJ46 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMIM22K7EJ46 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMIM22K7EJ46 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMIM22K7EJ46 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMIM22K7EJ46 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMIM22K7EJ46 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMIM22K7EJ46 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMIM22K7EJ46 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMIM22K7EJ46 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMIM22K7EJ46 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMIM22K7EJ46 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SMIM22K7EJ46 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMIM22K7EJ46 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMIM22K7EJ46 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMIM22K7EJ46 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMIM22K7EJ46 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMIM22K7EJ46 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SMIM22K7EJ46 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SMIM22K7EJ46 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SMIM22K7EJ46 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SMIM22K7EJ46 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SMIM22K7EJ46 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SMIM22K7EJ46 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SMIM22K7EJ46 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SMIM22K7EJ46 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SMIM22K7EJ46 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SMIM22K7EJ46 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SMIM22K7EJ46 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SMIM22K7EJ46 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SMIM22K7EJ46 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMIM22K7EJ46 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMIM22K7EJ46 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMIM22K7EJ46 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMIM22K7EJ46 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms