Protein–RNA interactions for Protein: J3QR89

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QR89 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
J3QR89 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
J3QR89 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
J3QR89 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
J3QR89 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
J3QR89 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
J3QR89 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
J3QR89 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
J3QR89 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
J3QR89 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
J3QR89 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
J3QR89 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
J3QR89 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
J3QR89 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
J3QR89 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
J3QR89 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
J3QR89 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
J3QR89 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
J3QR89 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
J3QR89 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
J3QR89 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
J3QR89 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
J3QR89 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
J3QR89 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
J3QR89 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
J3QR89 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
J3QR89 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
J3QR89 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
J3QR89 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
J3QR89 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
J3QR89 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
J3QR89 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
J3QR89 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
J3QR89 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
J3QR89 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
J3QR89 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
J3QR89 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
J3QR89 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
J3QR89 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
J3QR89 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
J3QR89 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
J3QR89 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
J3QR89 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
J3QR89 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
J3QR89 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
J3QR89 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
J3QR89 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
J3QR89 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
J3QR89 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
J3QR89 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
J3QR89 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
J3QR89 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
J3QR89 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
J3QR89 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
J3QR89 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
J3QR89 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
J3QR89 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
J3QR89 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
J3QR89 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
J3QR89 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
J3QR89 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
J3QR89 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
J3QR89 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
J3QR89 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
J3QR89 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
J3QR89 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
J3QR89 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
J3QR89 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
J3QR89 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
J3QR89 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
J3QR89 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
J3QR89 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
J3QR89 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
J3QR89 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
J3QR89 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
J3QR89 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
J3QR89 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
J3QR89 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
J3QR89 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
J3QR89 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
J3QR89 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
J3QR89 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
J3QR89 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
J3QR89 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
J3QR89 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
J3QR89 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
J3QR89 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
J3QR89 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
J3QR89 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
J3QR89 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
J3QR89 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
J3QR89 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
J3QR89 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
J3QR89 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
J3QR89 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
J3QR89 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
J3QR89 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
J3QR89 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
J3QR89 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
J3QR89 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms