Protein–RNA interactions for Protein: H3BVE0

BOLA2-SMG1P6, BOLA2-SMG1P6 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms