Protein–RNA interactions for Protein: E9PMD0

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PMD0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
E9PMD0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
E9PMD0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
E9PMD0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
E9PMD0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
E9PMD0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
E9PMD0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
E9PMD0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
E9PMD0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
E9PMD0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
E9PMD0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
E9PMD0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
E9PMD0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
E9PMD0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
E9PMD0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
E9PMD0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
E9PMD0 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
E9PMD0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
E9PMD0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
E9PMD0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
E9PMD0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
E9PMD0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
E9PMD0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
E9PMD0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
E9PMD0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
E9PMD0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
E9PMD0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
E9PMD0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
E9PMD0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
E9PMD0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
E9PMD0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
E9PMD0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
E9PMD0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
E9PMD0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
E9PMD0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
E9PMD0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
E9PMD0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
E9PMD0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
E9PMD0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
E9PMD0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
E9PMD0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
E9PMD0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
E9PMD0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
E9PMD0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
E9PMD0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
E9PMD0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
E9PMD0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25■■□□□ 1.59
E9PMD0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
E9PMD0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
E9PMD0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
E9PMD0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
E9PMD0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
E9PMD0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
E9PMD0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
E9PMD0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
E9PMD0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
E9PMD0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
E9PMD0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
E9PMD0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
E9PMD0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
E9PMD0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
E9PMD0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
E9PMD0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
E9PMD0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
E9PMD0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
E9PMD0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
E9PMD0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
E9PMD0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
E9PMD0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
E9PMD0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
E9PMD0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
E9PMD0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
E9PMD0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
E9PMD0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
E9PMD0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
E9PMD0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
E9PMD0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
E9PMD0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
E9PMD0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
E9PMD0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
E9PMD0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
E9PMD0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
E9PMD0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
E9PMD0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
E9PMD0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
E9PMD0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
E9PMD0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
E9PMD0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
E9PMD0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
E9PMD0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
E9PMD0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
E9PMD0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
E9PMD0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
E9PMD0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
E9PMD0 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
E9PMD0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
E9PMD0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
E9PMD0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
E9PMD0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
E9PMD0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms