Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PATL2C9JE40 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PATL2C9JE40 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PATL2C9JE40 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PATL2C9JE40 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PATL2C9JE40 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PATL2C9JE40 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PATL2C9JE40 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PATL2C9JE40 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PATL2C9JE40 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PATL2C9JE40 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PATL2C9JE40 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PATL2C9JE40 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PATL2C9JE40 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PATL2C9JE40 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PATL2C9JE40 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PATL2C9JE40 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PATL2C9JE40 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PATL2C9JE40 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PATL2C9JE40 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PATL2C9JE40 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PATL2C9JE40 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PATL2C9JE40 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PATL2C9JE40 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PATL2C9JE40 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PATL2C9JE40 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PATL2C9JE40 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PATL2C9JE40 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PATL2C9JE40 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PATL2C9JE40 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PATL2C9JE40 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PATL2C9JE40 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PATL2C9JE40 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PATL2C9JE40 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PATL2C9JE40 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PATL2C9JE40 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PATL2C9JE40 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PATL2C9JE40 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PATL2C9JE40 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PATL2C9JE40 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PATL2C9JE40 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PATL2C9JE40 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PATL2C9JE40 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PATL2C9JE40 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PATL2C9JE40 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PATL2C9JE40 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PATL2C9JE40 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PATL2C9JE40 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PATL2C9JE40 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PATL2C9JE40 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PATL2C9JE40 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PATL2C9JE40 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PATL2C9JE40 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PATL2C9JE40 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PATL2C9JE40 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PATL2C9JE40 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PATL2C9JE40 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PATL2C9JE40 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PATL2C9JE40 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PATL2C9JE40 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PATL2C9JE40 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PATL2C9JE40 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PATL2C9JE40 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PATL2C9JE40 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PATL2C9JE40 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PATL2C9JE40 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PATL2C9JE40 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PATL2C9JE40 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PATL2C9JE40 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PATL2C9JE40 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PATL2C9JE40 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PATL2C9JE40 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PATL2C9JE40 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PATL2C9JE40 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PATL2C9JE40 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PATL2C9JE40 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PATL2C9JE40 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PATL2C9JE40 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PATL2C9JE40 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
PATL2C9JE40 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PATL2C9JE40 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PATL2C9JE40 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PATL2C9JE40 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PATL2C9JE40 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PATL2C9JE40 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PATL2C9JE40 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PATL2C9JE40 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PATL2C9JE40 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PATL2C9JE40 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PATL2C9JE40 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PATL2C9JE40 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PATL2C9JE40 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PATL2C9JE40 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PATL2C9JE40 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PATL2C9JE40 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PATL2C9JE40 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PATL2C9JE40 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PATL2C9JE40 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PATL2C9JE40 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PATL2C9JE40 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms