Protein–RNA interactions for Protein: A8K0R7

ZNF839, Zinc finger protein 839, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF839A8K0R7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF839A8K0R7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF839A8K0R7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF839A8K0R7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF839A8K0R7 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF839A8K0R7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF839A8K0R7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF839A8K0R7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF839A8K0R7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF839A8K0R7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF839A8K0R7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF839A8K0R7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF839A8K0R7 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF839A8K0R7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF839A8K0R7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF839A8K0R7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ZNF839A8K0R7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF839A8K0R7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF839A8K0R7 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF839A8K0R7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF839A8K0R7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF839A8K0R7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF839A8K0R7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF839A8K0R7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF839A8K0R7 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF839A8K0R7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF839A8K0R7 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF839A8K0R7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF839A8K0R7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF839A8K0R7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF839A8K0R7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF839A8K0R7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF839A8K0R7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF839A8K0R7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF839A8K0R7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF839A8K0R7 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF839A8K0R7 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF839A8K0R7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF839A8K0R7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF839A8K0R7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF839A8K0R7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF839A8K0R7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF839A8K0R7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF839A8K0R7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF839A8K0R7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF839A8K0R7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF839A8K0R7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF839A8K0R7 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF839A8K0R7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF839A8K0R7 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF839A8K0R7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF839A8K0R7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF839A8K0R7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF839A8K0R7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF839A8K0R7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF839A8K0R7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF839A8K0R7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF839A8K0R7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF839A8K0R7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF839A8K0R7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF839A8K0R7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF839A8K0R7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF839A8K0R7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF839A8K0R7 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF839A8K0R7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF839A8K0R7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF839A8K0R7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF839A8K0R7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF839A8K0R7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF839A8K0R7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF839A8K0R7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF839A8K0R7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF839A8K0R7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF839A8K0R7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF839A8K0R7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF839A8K0R7 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF839A8K0R7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF839A8K0R7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF839A8K0R7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF839A8K0R7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF839A8K0R7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF839A8K0R7 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF839A8K0R7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF839A8K0R7 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF839A8K0R7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF839A8K0R7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF839A8K0R7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF839A8K0R7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF839A8K0R7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF839A8K0R7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF839A8K0R7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF839A8K0R7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF839A8K0R7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF839A8K0R7 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF839A8K0R7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF839A8K0R7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF839A8K0R7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF839A8K0R7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF839A8K0R7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF839A8K0R7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms