Protein–RNA interactions for Protein: A6XGL0

YJEFN3, YjeF N-terminal domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YJEFN3A6XGL0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
YJEFN3A6XGL0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
YJEFN3A6XGL0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
YJEFN3A6XGL0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
YJEFN3A6XGL0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
YJEFN3A6XGL0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
YJEFN3A6XGL0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
YJEFN3A6XGL0 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
YJEFN3A6XGL0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
YJEFN3A6XGL0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
YJEFN3A6XGL0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
YJEFN3A6XGL0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
YJEFN3A6XGL0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
YJEFN3A6XGL0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
YJEFN3A6XGL0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
YJEFN3A6XGL0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
YJEFN3A6XGL0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
YJEFN3A6XGL0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
YJEFN3A6XGL0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
YJEFN3A6XGL0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
YJEFN3A6XGL0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
YJEFN3A6XGL0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
YJEFN3A6XGL0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
YJEFN3A6XGL0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
YJEFN3A6XGL0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
YJEFN3A6XGL0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
YJEFN3A6XGL0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
YJEFN3A6XGL0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
YJEFN3A6XGL0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
YJEFN3A6XGL0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
YJEFN3A6XGL0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
YJEFN3A6XGL0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
YJEFN3A6XGL0 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
YJEFN3A6XGL0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
YJEFN3A6XGL0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
YJEFN3A6XGL0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
YJEFN3A6XGL0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
YJEFN3A6XGL0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
YJEFN3A6XGL0 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
YJEFN3A6XGL0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
YJEFN3A6XGL0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
YJEFN3A6XGL0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
YJEFN3A6XGL0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
YJEFN3A6XGL0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
YJEFN3A6XGL0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
YJEFN3A6XGL0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
YJEFN3A6XGL0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
YJEFN3A6XGL0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
YJEFN3A6XGL0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
YJEFN3A6XGL0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
YJEFN3A6XGL0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
YJEFN3A6XGL0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
YJEFN3A6XGL0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
YJEFN3A6XGL0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
YJEFN3A6XGL0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
YJEFN3A6XGL0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
YJEFN3A6XGL0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
YJEFN3A6XGL0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
YJEFN3A6XGL0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
YJEFN3A6XGL0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
YJEFN3A6XGL0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
YJEFN3A6XGL0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
YJEFN3A6XGL0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
YJEFN3A6XGL0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
YJEFN3A6XGL0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
YJEFN3A6XGL0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
YJEFN3A6XGL0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
YJEFN3A6XGL0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
YJEFN3A6XGL0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
YJEFN3A6XGL0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
YJEFN3A6XGL0 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
YJEFN3A6XGL0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
YJEFN3A6XGL0 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
YJEFN3A6XGL0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
YJEFN3A6XGL0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
YJEFN3A6XGL0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
YJEFN3A6XGL0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
YJEFN3A6XGL0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
YJEFN3A6XGL0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
YJEFN3A6XGL0 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
YJEFN3A6XGL0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
YJEFN3A6XGL0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
YJEFN3A6XGL0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
YJEFN3A6XGL0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
YJEFN3A6XGL0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
YJEFN3A6XGL0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
YJEFN3A6XGL0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
YJEFN3A6XGL0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
YJEFN3A6XGL0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
YJEFN3A6XGL0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
YJEFN3A6XGL0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
YJEFN3A6XGL0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
YJEFN3A6XGL0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
YJEFN3A6XGL0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
YJEFN3A6XGL0 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
YJEFN3A6XGL0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
YJEFN3A6XGL0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
YJEFN3A6XGL0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
YJEFN3A6XGL0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
YJEFN3A6XGL0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms