Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC169A6NNP5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC169A6NNP5 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC169A6NNP5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC169A6NNP5 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC169A6NNP5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC169A6NNP5 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC169A6NNP5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC169A6NNP5 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC169A6NNP5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC169A6NNP5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC169A6NNP5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC169A6NNP5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC169A6NNP5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC169A6NNP5 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC169A6NNP5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC169A6NNP5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC169A6NNP5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC169A6NNP5 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC169A6NNP5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC169A6NNP5 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC169A6NNP5 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC169A6NNP5 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC169A6NNP5 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC169A6NNP5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC169A6NNP5 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC169A6NNP5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC169A6NNP5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC169A6NNP5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC169A6NNP5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC169A6NNP5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC169A6NNP5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC169A6NNP5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC169A6NNP5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC169A6NNP5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC169A6NNP5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC169A6NNP5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC169A6NNP5 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC169A6NNP5 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC169A6NNP5 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC169A6NNP5 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC169A6NNP5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC169A6NNP5 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC169A6NNP5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC169A6NNP5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC169A6NNP5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC169A6NNP5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC169A6NNP5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC169A6NNP5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC169A6NNP5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC169A6NNP5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC169A6NNP5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC169A6NNP5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC169A6NNP5 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC169A6NNP5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC169A6NNP5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC169A6NNP5 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC169A6NNP5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC169A6NNP5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC169A6NNP5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC169A6NNP5 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC169A6NNP5 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC169A6NNP5 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC169A6NNP5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC169A6NNP5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC169A6NNP5 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC169A6NNP5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC169A6NNP5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC169A6NNP5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC169A6NNP5 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC169A6NNP5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC169A6NNP5 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC169A6NNP5 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC169A6NNP5 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC169A6NNP5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC169A6NNP5 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC169A6NNP5 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC169A6NNP5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC169A6NNP5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC169A6NNP5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC169A6NNP5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC169A6NNP5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC169A6NNP5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC169A6NNP5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC169A6NNP5 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC169A6NNP5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC169A6NNP5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC169A6NNP5 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC169A6NNP5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC169A6NNP5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC169A6NNP5 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC169A6NNP5 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC169A6NNP5 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC169A6NNP5 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC169A6NNP5 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC169A6NNP5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC169A6NNP5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC169A6NNP5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC169A6NNP5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC169A6NNP5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms