Protein–RNA interactions for Protein: A6NK53

ZNF233, Zinc finger protein 233, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF233A6NK53 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF233A6NK53 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF233A6NK53 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF233A6NK53 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF233A6NK53 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF233A6NK53 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF233A6NK53 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF233A6NK53 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF233A6NK53 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF233A6NK53 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF233A6NK53 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF233A6NK53 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF233A6NK53 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF233A6NK53 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF233A6NK53 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF233A6NK53 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF233A6NK53 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF233A6NK53 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF233A6NK53 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF233A6NK53 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF233A6NK53 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF233A6NK53 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF233A6NK53 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF233A6NK53 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF233A6NK53 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF233A6NK53 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF233A6NK53 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF233A6NK53 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF233A6NK53 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF233A6NK53 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF233A6NK53 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF233A6NK53 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF233A6NK53 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF233A6NK53 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF233A6NK53 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF233A6NK53 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF233A6NK53 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF233A6NK53 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF233A6NK53 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF233A6NK53 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF233A6NK53 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF233A6NK53 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF233A6NK53 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF233A6NK53 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF233A6NK53 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF233A6NK53 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF233A6NK53 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF233A6NK53 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF233A6NK53 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF233A6NK53 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF233A6NK53 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF233A6NK53 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF233A6NK53 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF233A6NK53 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
ZNF233A6NK53 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF233A6NK53 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF233A6NK53 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF233A6NK53 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF233A6NK53 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF233A6NK53 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF233A6NK53 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF233A6NK53 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF233A6NK53 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF233A6NK53 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF233A6NK53 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF233A6NK53 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF233A6NK53 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF233A6NK53 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF233A6NK53 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF233A6NK53 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF233A6NK53 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF233A6NK53 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF233A6NK53 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF233A6NK53 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF233A6NK53 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF233A6NK53 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF233A6NK53 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF233A6NK53 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF233A6NK53 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF233A6NK53 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF233A6NK53 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF233A6NK53 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF233A6NK53 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF233A6NK53 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF233A6NK53 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF233A6NK53 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF233A6NK53 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF233A6NK53 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF233A6NK53 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF233A6NK53 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF233A6NK53 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF233A6NK53 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF233A6NK53 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF233A6NK53 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF233A6NK53 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF233A6NK53 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF233A6NK53 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF233A6NK53 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF233A6NK53 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF233A6NK53 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms