Protein–RNA interactions for Protein: A6NIK2

LRRC10B, Leucine-rich repeat-containing protein 10B, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC10BA6NIK2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC10BA6NIK2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC10BA6NIK2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC10BA6NIK2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC10BA6NIK2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC10BA6NIK2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC10BA6NIK2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC10BA6NIK2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC10BA6NIK2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC10BA6NIK2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC10BA6NIK2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC10BA6NIK2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC10BA6NIK2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC10BA6NIK2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC10BA6NIK2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC10BA6NIK2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC10BA6NIK2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC10BA6NIK2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC10BA6NIK2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC10BA6NIK2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC10BA6NIK2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC10BA6NIK2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC10BA6NIK2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC10BA6NIK2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC10BA6NIK2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC10BA6NIK2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC10BA6NIK2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC10BA6NIK2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC10BA6NIK2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC10BA6NIK2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC10BA6NIK2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC10BA6NIK2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC10BA6NIK2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC10BA6NIK2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC10BA6NIK2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC10BA6NIK2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC10BA6NIK2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC10BA6NIK2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC10BA6NIK2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC10BA6NIK2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC10BA6NIK2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC10BA6NIK2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC10BA6NIK2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC10BA6NIK2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC10BA6NIK2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC10BA6NIK2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC10BA6NIK2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC10BA6NIK2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC10BA6NIK2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC10BA6NIK2 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC10BA6NIK2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC10BA6NIK2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC10BA6NIK2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC10BA6NIK2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC10BA6NIK2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC10BA6NIK2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC10BA6NIK2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC10BA6NIK2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC10BA6NIK2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC10BA6NIK2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC10BA6NIK2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC10BA6NIK2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC10BA6NIK2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC10BA6NIK2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC10BA6NIK2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC10BA6NIK2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC10BA6NIK2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC10BA6NIK2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC10BA6NIK2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LRRC10BA6NIK2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LRRC10BA6NIK2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC10BA6NIK2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC10BA6NIK2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC10BA6NIK2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC10BA6NIK2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC10BA6NIK2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC10BA6NIK2 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC10BA6NIK2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC10BA6NIK2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC10BA6NIK2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC10BA6NIK2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC10BA6NIK2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC10BA6NIK2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC10BA6NIK2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC10BA6NIK2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC10BA6NIK2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC10BA6NIK2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC10BA6NIK2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC10BA6NIK2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC10BA6NIK2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC10BA6NIK2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC10BA6NIK2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC10BA6NIK2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC10BA6NIK2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC10BA6NIK2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC10BA6NIK2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC10BA6NIK2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC10BA6NIK2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC10BA6NIK2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC10BA6NIK2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms