Protein–RNA interactions for Protein: A6NHN6

NPIPB15, Nuclear pore complex-interacting protein family member B15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB15A6NHN6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPIPB15A6NHN6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPIPB15A6NHN6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NPIPB15A6NHN6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPIPB15A6NHN6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPIPB15A6NHN6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPIPB15A6NHN6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPIPB15A6NHN6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPIPB15A6NHN6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NPIPB15A6NHN6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NPIPB15A6NHN6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NPIPB15A6NHN6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NPIPB15A6NHN6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NPIPB15A6NHN6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NPIPB15A6NHN6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NPIPB15A6NHN6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NPIPB15A6NHN6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NPIPB15A6NHN6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NPIPB15A6NHN6 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NPIPB15A6NHN6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPIPB15A6NHN6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPIPB15A6NHN6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NPIPB15A6NHN6 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPIPB15A6NHN6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPIPB15A6NHN6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPIPB15A6NHN6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NPIPB15A6NHN6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPIPB15A6NHN6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NPIPB15A6NHN6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NPIPB15A6NHN6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NPIPB15A6NHN6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NPIPB15A6NHN6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NPIPB15A6NHN6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NPIPB15A6NHN6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NPIPB15A6NHN6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NPIPB15A6NHN6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NPIPB15A6NHN6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NPIPB15A6NHN6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NPIPB15A6NHN6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NPIPB15A6NHN6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NPIPB15A6NHN6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NPIPB15A6NHN6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NPIPB15A6NHN6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NPIPB15A6NHN6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NPIPB15A6NHN6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NPIPB15A6NHN6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NPIPB15A6NHN6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NPIPB15A6NHN6 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NPIPB15A6NHN6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NPIPB15A6NHN6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NPIPB15A6NHN6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NPIPB15A6NHN6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPIPB15A6NHN6 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPIPB15A6NHN6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPIPB15A6NHN6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPIPB15A6NHN6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPIPB15A6NHN6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NPIPB15A6NHN6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NPIPB15A6NHN6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NPIPB15A6NHN6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NPIPB15A6NHN6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPIPB15A6NHN6 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NPIPB15A6NHN6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPIPB15A6NHN6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPIPB15A6NHN6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPIPB15A6NHN6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPIPB15A6NHN6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPIPB15A6NHN6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPIPB15A6NHN6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPIPB15A6NHN6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPIPB15A6NHN6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPIPB15A6NHN6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPIPB15A6NHN6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPIPB15A6NHN6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPIPB15A6NHN6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPIPB15A6NHN6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPIPB15A6NHN6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPIPB15A6NHN6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPIPB15A6NHN6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPIPB15A6NHN6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPIPB15A6NHN6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPIPB15A6NHN6 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPIPB15A6NHN6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPIPB15A6NHN6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPIPB15A6NHN6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPIPB15A6NHN6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPIPB15A6NHN6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NPIPB15A6NHN6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NPIPB15A6NHN6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NPIPB15A6NHN6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NPIPB15A6NHN6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NPIPB15A6NHN6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPIPB15A6NHN6 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPIPB15A6NHN6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPIPB15A6NHN6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPIPB15A6NHN6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPIPB15A6NHN6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPIPB15A6NHN6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPIPB15A6NHN6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPIPB15A6NHN6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms