Protein–RNA interactions for Protein: A6NEH6

TMEM247, Transmembrane protein 247, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM247A6NEH6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM247A6NEH6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM247A6NEH6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM247A6NEH6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM247A6NEH6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM247A6NEH6 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM247A6NEH6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM247A6NEH6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM247A6NEH6 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM247A6NEH6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM247A6NEH6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM247A6NEH6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM247A6NEH6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM247A6NEH6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM247A6NEH6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM247A6NEH6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM247A6NEH6 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM247A6NEH6 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM247A6NEH6 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM247A6NEH6 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM247A6NEH6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM247A6NEH6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM247A6NEH6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM247A6NEH6 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM247A6NEH6 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM247A6NEH6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM247A6NEH6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM247A6NEH6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM247A6NEH6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM247A6NEH6 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM247A6NEH6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM247A6NEH6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM247A6NEH6 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM247A6NEH6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM247A6NEH6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM247A6NEH6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM247A6NEH6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM247A6NEH6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM247A6NEH6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM247A6NEH6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM247A6NEH6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM247A6NEH6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM247A6NEH6 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM247A6NEH6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM247A6NEH6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM247A6NEH6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM247A6NEH6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM247A6NEH6 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM247A6NEH6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM247A6NEH6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM247A6NEH6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM247A6NEH6 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM247A6NEH6 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM247A6NEH6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM247A6NEH6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM247A6NEH6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM247A6NEH6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM247A6NEH6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM247A6NEH6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM247A6NEH6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM247A6NEH6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM247A6NEH6 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM247A6NEH6 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM247A6NEH6 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM247A6NEH6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM247A6NEH6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM247A6NEH6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM247A6NEH6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM247A6NEH6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM247A6NEH6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM247A6NEH6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM247A6NEH6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM247A6NEH6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM247A6NEH6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM247A6NEH6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM247A6NEH6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM247A6NEH6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM247A6NEH6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM247A6NEH6 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM247A6NEH6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM247A6NEH6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM247A6NEH6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM247A6NEH6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM247A6NEH6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM247A6NEH6 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM247A6NEH6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM247A6NEH6 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM247A6NEH6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM247A6NEH6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM247A6NEH6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM247A6NEH6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM247A6NEH6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM247A6NEH6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM247A6NEH6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TMEM247A6NEH6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM247A6NEH6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM247A6NEH6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM247A6NEH6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM247A6NEH6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM247A6NEH6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms