Protein–RNA interactions for Protein: A4D1F6

LRRD1, Leucine-rich repeat and death domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRD1A4D1F6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRD1A4D1F6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRD1A4D1F6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRD1A4D1F6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRD1A4D1F6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRD1A4D1F6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRD1A4D1F6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRD1A4D1F6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRD1A4D1F6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRRD1A4D1F6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRRD1A4D1F6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRRD1A4D1F6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRD1A4D1F6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRD1A4D1F6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRD1A4D1F6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRD1A4D1F6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRD1A4D1F6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRD1A4D1F6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRD1A4D1F6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRD1A4D1F6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRD1A4D1F6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRD1A4D1F6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRD1A4D1F6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRD1A4D1F6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRD1A4D1F6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRD1A4D1F6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRD1A4D1F6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRD1A4D1F6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRD1A4D1F6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRD1A4D1F6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRD1A4D1F6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRD1A4D1F6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRD1A4D1F6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRD1A4D1F6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRD1A4D1F6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRD1A4D1F6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRD1A4D1F6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRD1A4D1F6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRD1A4D1F6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRD1A4D1F6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRD1A4D1F6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRD1A4D1F6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRD1A4D1F6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRD1A4D1F6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRD1A4D1F6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRD1A4D1F6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRD1A4D1F6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRD1A4D1F6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRD1A4D1F6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRD1A4D1F6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRD1A4D1F6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRD1A4D1F6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRD1A4D1F6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRD1A4D1F6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRD1A4D1F6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRD1A4D1F6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRD1A4D1F6 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRD1A4D1F6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRD1A4D1F6 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRD1A4D1F6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRD1A4D1F6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRD1A4D1F6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRD1A4D1F6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRD1A4D1F6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRD1A4D1F6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRD1A4D1F6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRD1A4D1F6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRD1A4D1F6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRD1A4D1F6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRD1A4D1F6 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRD1A4D1F6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRD1A4D1F6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRD1A4D1F6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRD1A4D1F6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRD1A4D1F6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRD1A4D1F6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRD1A4D1F6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRD1A4D1F6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRD1A4D1F6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRD1A4D1F6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRD1A4D1F6 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRD1A4D1F6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRD1A4D1F6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRD1A4D1F6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRD1A4D1F6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRD1A4D1F6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRD1A4D1F6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
LRRD1A4D1F6 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LRRD1A4D1F6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LRRD1A4D1F6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LRRD1A4D1F6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRD1A4D1F6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRD1A4D1F6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRD1A4D1F6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRD1A4D1F6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRD1A4D1F6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRD1A4D1F6 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRD1A4D1F6 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRD1A4D1F6 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRD1A4D1F6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms