Protein–RNA interactions for Protein: A2A3N6

PIPSL, Putative PIP5K1A and PSMD4-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIPSLA2A3N6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PIPSLA2A3N6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PIPSLA2A3N6 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PIPSLA2A3N6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PIPSLA2A3N6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PIPSLA2A3N6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PIPSLA2A3N6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PIPSLA2A3N6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PIPSLA2A3N6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PIPSLA2A3N6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PIPSLA2A3N6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PIPSLA2A3N6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PIPSLA2A3N6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PIPSLA2A3N6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PIPSLA2A3N6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PIPSLA2A3N6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PIPSLA2A3N6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PIPSLA2A3N6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PIPSLA2A3N6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PIPSLA2A3N6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PIPSLA2A3N6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PIPSLA2A3N6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PIPSLA2A3N6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PIPSLA2A3N6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PIPSLA2A3N6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PIPSLA2A3N6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PIPSLA2A3N6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PIPSLA2A3N6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PIPSLA2A3N6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PIPSLA2A3N6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PIPSLA2A3N6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PIPSLA2A3N6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PIPSLA2A3N6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PIPSLA2A3N6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PIPSLA2A3N6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PIPSLA2A3N6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PIPSLA2A3N6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PIPSLA2A3N6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PIPSLA2A3N6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PIPSLA2A3N6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PIPSLA2A3N6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PIPSLA2A3N6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PIPSLA2A3N6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PIPSLA2A3N6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PIPSLA2A3N6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PIPSLA2A3N6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PIPSLA2A3N6 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PIPSLA2A3N6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PIPSLA2A3N6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PIPSLA2A3N6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PIPSLA2A3N6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PIPSLA2A3N6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PIPSLA2A3N6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PIPSLA2A3N6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PIPSLA2A3N6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PIPSLA2A3N6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PIPSLA2A3N6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PIPSLA2A3N6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PIPSLA2A3N6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PIPSLA2A3N6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PIPSLA2A3N6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PIPSLA2A3N6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PIPSLA2A3N6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PIPSLA2A3N6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PIPSLA2A3N6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PIPSLA2A3N6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PIPSLA2A3N6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PIPSLA2A3N6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PIPSLA2A3N6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PIPSLA2A3N6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PIPSLA2A3N6 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PIPSLA2A3N6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PIPSLA2A3N6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PIPSLA2A3N6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PIPSLA2A3N6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PIPSLA2A3N6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PIPSLA2A3N6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PIPSLA2A3N6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PIPSLA2A3N6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PIPSLA2A3N6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PIPSLA2A3N6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PIPSLA2A3N6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PIPSLA2A3N6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PIPSLA2A3N6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PIPSLA2A3N6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PIPSLA2A3N6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PIPSLA2A3N6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PIPSLA2A3N6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PIPSLA2A3N6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PIPSLA2A3N6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PIPSLA2A3N6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PIPSLA2A3N6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PIPSLA2A3N6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PIPSLA2A3N6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PIPSLA2A3N6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PIPSLA2A3N6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PIPSLA2A3N6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PIPSLA2A3N6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PIPSLA2A3N6 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PIPSLA2A3N6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms