Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q9

GTF3C3, General transcription factor 3C polypeptide 3, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC37.94■■■■□ 3.66
GTF3C3Q9Y5Q9 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
GTF3C3Q9Y5Q9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
GTF3C3Q9Y5Q9 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC37.93■■■■□ 3.66
GTF3C3Q9Y5Q9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
GTF3C3Q9Y5Q9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
GTF3C3Q9Y5Q9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
GTF3C3Q9Y5Q9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
GTF3C3Q9Y5Q9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
GTF3C3Q9Y5Q9 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
GTF3C3Q9Y5Q9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
GTF3C3Q9Y5Q9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
GTF3C3Q9Y5Q9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
GTF3C3Q9Y5Q9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
GTF3C3Q9Y5Q9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
GTF3C3Q9Y5Q9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
GTF3C3Q9Y5Q9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
GTF3C3Q9Y5Q9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
GTF3C3Q9Y5Q9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
GTF3C3Q9Y5Q9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
GTF3C3Q9Y5Q9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
GTF3C3Q9Y5Q9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
GTF3C3Q9Y5Q9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
GTF3C3Q9Y5Q9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC37.61■■■■□ 3.61
GTF3C3Q9Y5Q9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
GTF3C3Q9Y5Q9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
GTF3C3Q9Y5Q9 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
GTF3C3Q9Y5Q9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
GTF3C3Q9Y5Q9 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
GTF3C3Q9Y5Q9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
GTF3C3Q9Y5Q9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
GTF3C3Q9Y5Q9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
GTF3C3Q9Y5Q9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
GTF3C3Q9Y5Q9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
GTF3C3Q9Y5Q9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
GTF3C3Q9Y5Q9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC37.47■■■■□ 3.59
GTF3C3Q9Y5Q9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
GTF3C3Q9Y5Q9 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
GTF3C3Q9Y5Q9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
GTF3C3Q9Y5Q9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
GTF3C3Q9Y5Q9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC37.43■■■■□ 3.58
GTF3C3Q9Y5Q9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
GTF3C3Q9Y5Q9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
GTF3C3Q9Y5Q9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
GTF3C3Q9Y5Q9 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
GTF3C3Q9Y5Q9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
GTF3C3Q9Y5Q9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
GTF3C3Q9Y5Q9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
GTF3C3Q9Y5Q9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
GTF3C3Q9Y5Q9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
GTF3C3Q9Y5Q9 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
GTF3C3Q9Y5Q9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
GTF3C3Q9Y5Q9 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
GTF3C3Q9Y5Q9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
GTF3C3Q9Y5Q9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC37.32■■■■□ 3.57
GTF3C3Q9Y5Q9 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
GTF3C3Q9Y5Q9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
GTF3C3Q9Y5Q9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
GTF3C3Q9Y5Q9 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
GTF3C3Q9Y5Q9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.55
GTF3C3Q9Y5Q9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
GTF3C3Q9Y5Q9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
GTF3C3Q9Y5Q9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
GTF3C3Q9Y5Q9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
GTF3C3Q9Y5Q9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
GTF3C3Q9Y5Q9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
GTF3C3Q9Y5Q9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
GTF3C3Q9Y5Q9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
GTF3C3Q9Y5Q9 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
GTF3C3Q9Y5Q9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
GTF3C3Q9Y5Q9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
GTF3C3Q9Y5Q9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
GTF3C3Q9Y5Q9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
GTF3C3Q9Y5Q9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
GTF3C3Q9Y5Q9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC37.14■■■■□ 3.54
GTF3C3Q9Y5Q9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
GTF3C3Q9Y5Q9 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.53
GTF3C3Q9Y5Q9 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
GTF3C3Q9Y5Q9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
GTF3C3Q9Y5Q9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
GTF3C3Q9Y5Q9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
GTF3C3Q9Y5Q9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.52
GTF3C3Q9Y5Q9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
GTF3C3Q9Y5Q9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
GTF3C3Q9Y5Q9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
GTF3C3Q9Y5Q9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
GTF3C3Q9Y5Q9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
GTF3C3Q9Y5Q9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
GTF3C3Q9Y5Q9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
GTF3C3Q9Y5Q9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
GTF3C3Q9Y5Q9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
GTF3C3Q9Y5Q9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
GTF3C3Q9Y5Q9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms