Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNIP3Q9Y2W7 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNIP3Q9Y2W7 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNIP3Q9Y2W7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNIP3Q9Y2W7 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KCNIP3Q9Y2W7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNIP3Q9Y2W7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNIP3Q9Y2W7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNIP3Q9Y2W7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNIP3Q9Y2W7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNIP3Q9Y2W7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNIP3Q9Y2W7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNIP3Q9Y2W7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNIP3Q9Y2W7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNIP3Q9Y2W7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCNIP3Q9Y2W7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCNIP3Q9Y2W7 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNIP3Q9Y2W7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNIP3Q9Y2W7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNIP3Q9Y2W7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCNIP3Q9Y2W7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KCNIP3Q9Y2W7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KCNIP3Q9Y2W7 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNIP3Q9Y2W7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNIP3Q9Y2W7 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNIP3Q9Y2W7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNIP3Q9Y2W7 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNIP3Q9Y2W7 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNIP3Q9Y2W7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNIP3Q9Y2W7 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNIP3Q9Y2W7 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNIP3Q9Y2W7 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNIP3Q9Y2W7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNIP3Q9Y2W7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNIP3Q9Y2W7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNIP3Q9Y2W7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNIP3Q9Y2W7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNIP3Q9Y2W7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNIP3Q9Y2W7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNIP3Q9Y2W7 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNIP3Q9Y2W7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KCNIP3Q9Y2W7 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNIP3Q9Y2W7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNIP3Q9Y2W7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNIP3Q9Y2W7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNIP3Q9Y2W7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNIP3Q9Y2W7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNIP3Q9Y2W7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNIP3Q9Y2W7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNIP3Q9Y2W7 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNIP3Q9Y2W7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNIP3Q9Y2W7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNIP3Q9Y2W7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KCNIP3Q9Y2W7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNIP3Q9Y2W7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNIP3Q9Y2W7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNIP3Q9Y2W7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNIP3Q9Y2W7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNIP3Q9Y2W7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNIP3Q9Y2W7 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNIP3Q9Y2W7 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNIP3Q9Y2W7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNIP3Q9Y2W7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNIP3Q9Y2W7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNIP3Q9Y2W7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNIP3Q9Y2W7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNIP3Q9Y2W7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNIP3Q9Y2W7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNIP3Q9Y2W7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNIP3Q9Y2W7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
KCNIP3Q9Y2W7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNIP3Q9Y2W7 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNIP3Q9Y2W7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNIP3Q9Y2W7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNIP3Q9Y2W7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNIP3Q9Y2W7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNIP3Q9Y2W7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNIP3Q9Y2W7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNIP3Q9Y2W7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNIP3Q9Y2W7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNIP3Q9Y2W7 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNIP3Q9Y2W7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNIP3Q9Y2W7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
KCNIP3Q9Y2W7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNIP3Q9Y2W7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNIP3Q9Y2W7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNIP3Q9Y2W7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNIP3Q9Y2W7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNIP3Q9Y2W7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNIP3Q9Y2W7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNIP3Q9Y2W7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNIP3Q9Y2W7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNIP3Q9Y2W7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCNIP3Q9Y2W7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCNIP3Q9Y2W7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNIP3Q9Y2W7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNIP3Q9Y2W7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 275.4 ms