Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBI1

COMMD3, COMM domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 195 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD3Q9UBI1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COMMD3Q9UBI1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COMMD3Q9UBI1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COMMD3Q9UBI1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COMMD3Q9UBI1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COMMD3Q9UBI1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
COMMD3Q9UBI1 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COMMD3Q9UBI1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COMMD3Q9UBI1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COMMD3Q9UBI1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COMMD3Q9UBI1 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COMMD3Q9UBI1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COMMD3Q9UBI1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COMMD3Q9UBI1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
COMMD3Q9UBI1 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COMMD3Q9UBI1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COMMD3Q9UBI1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
COMMD3Q9UBI1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
COMMD3Q9UBI1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
COMMD3Q9UBI1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
COMMD3Q9UBI1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
COMMD3Q9UBI1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
COMMD3Q9UBI1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COMMD3Q9UBI1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COMMD3Q9UBI1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COMMD3Q9UBI1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COMMD3Q9UBI1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COMMD3Q9UBI1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COMMD3Q9UBI1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COMMD3Q9UBI1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COMMD3Q9UBI1 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COMMD3Q9UBI1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COMMD3Q9UBI1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COMMD3Q9UBI1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
COMMD3Q9UBI1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
COMMD3Q9UBI1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COMMD3Q9UBI1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COMMD3Q9UBI1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COMMD3Q9UBI1 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COMMD3Q9UBI1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COMMD3Q9UBI1 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COMMD3Q9UBI1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COMMD3Q9UBI1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COMMD3Q9UBI1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COMMD3Q9UBI1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COMMD3Q9UBI1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COMMD3Q9UBI1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COMMD3Q9UBI1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COMMD3Q9UBI1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COMMD3Q9UBI1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COMMD3Q9UBI1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COMMD3Q9UBI1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
COMMD3Q9UBI1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
COMMD3Q9UBI1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COMMD3Q9UBI1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COMMD3Q9UBI1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
COMMD3Q9UBI1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
COMMD3Q9UBI1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COMMD3Q9UBI1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COMMD3Q9UBI1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
COMMD3Q9UBI1 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COMMD3Q9UBI1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COMMD3Q9UBI1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COMMD3Q9UBI1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
COMMD3Q9UBI1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COMMD3Q9UBI1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COMMD3Q9UBI1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
COMMD3Q9UBI1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COMMD3Q9UBI1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COMMD3Q9UBI1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COMMD3Q9UBI1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COMMD3Q9UBI1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
COMMD3Q9UBI1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COMMD3Q9UBI1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COMMD3Q9UBI1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COMMD3Q9UBI1 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COMMD3Q9UBI1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
COMMD3Q9UBI1 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COMMD3Q9UBI1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COMMD3Q9UBI1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COMMD3Q9UBI1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COMMD3Q9UBI1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COMMD3Q9UBI1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COMMD3Q9UBI1 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COMMD3Q9UBI1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
COMMD3Q9UBI1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COMMD3Q9UBI1 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
COMMD3Q9UBI1 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COMMD3Q9UBI1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COMMD3Q9UBI1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COMMD3Q9UBI1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
COMMD3Q9UBI1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
COMMD3Q9UBI1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COMMD3Q9UBI1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
COMMD3Q9UBI1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COMMD3Q9UBI1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COMMD3Q9UBI1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COMMD3Q9UBI1 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COMMD3Q9UBI1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COMMD3Q9UBI1 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
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